应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » 请问如何用GenAlEx 基于 SSR 标记计算多态性信息含量 PIC ?
北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
61/1返回列表
查看: 6619  |  回复: 5
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

zmrc

新虫 (初入文坛)

[求助] 请问如何用GenAlEx 基于 SSR 标记计算多态性信息含量 PIC ? 已有1人参与

如题，请问如何用GenAlEx 基于 SSR 标记 计算多态性信息含量 PIC ？
回复此楼

» 猜你喜欢
1楼 2017-07-15 20:33:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

晋鹏

版主 (知名作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
西门吹雪170: 金币+3, 鼓励回帖交流 2017-07-15 23:28:39
1、Cervus v3.0或者直接下载PIC-CALC计算程式。

2、多态信息含量（polymorphism information content，PIC）。
根据Bostein等（1980）。
多态信息含量是表示微卫星DNA变异程度高低的一个指标，反映微卫星DNA多态高低，计算公式如下：
PIC=1-∑pi2-∑∑2pi2pj2
式中：Pi、Pj分别为群体中第i、j个等位基因频率，n为等位基因数。
赞一下(1人) 回复此楼
及时行乐，人生不留遗憾！
2楼2017-07-15 21:22:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zmrc

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 晋鹏 at 2017-07-15 21:22:36
1、Cervus v3.0或者直接下载PIC-CALC计算程式。

2、多态信息含量（polymorphism information content，PIC）。
根据Bostein等（1980）。
多态信息含量是表示微卫星DNA变异程度高低的一个指标，反映微卫星DNA多 ...

谢谢，想用 GenAlEx ~
赞一下 回复此楼
3楼2017-07-15 21:58:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

晋鹏

版主 (知名作家)
引用回帖:
3楼: Originally posted by zmrc at 2017-07-15 21:58:40
谢谢，想用 GenAlEx ~...

那很简单啊，直接软件就可以了。
赞一下(1人) 回复此楼
及时行乐，人生不留遗憾！
4楼2017-07-15 22:03:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zmrc

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 晋鹏 at 2017-07-15 22:03:17
那很简单啊，直接软件就可以了。...

没有找到用 GenAlEx 计算 PIC 的功能在哪里~
赞一下 回复此楼
5楼2017-07-15 22:28:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

摩羯赵哒哒

新虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by zmrc at 2017-07-15 21:58:40
谢谢，想用 GenAlEx ~...

您好，我也是做ssr，想用genalex软件，但是不知道该软件该如何统计ssr格式？我是按基因型统计的，可是软件没有这种输入格式呢，求解答，谢谢

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
6楼2018-01-12 20:36:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 zmrc 的主题更新
61/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 求调剂 +4 QiMing7 2026-03-25 5/250 2026-03-29 21:10 by 唐沐儿
[考研] 337求调剂 +4 《树》 2026-03-29 4/200 2026-03-29 20:52 by 唐沐儿
[考研] 299求调剂 +10 15188958825 2026-03-25 10/500 2026-03-29 17:51 by 王亮_大连医科大
[考研] 086000生物与医药调剂 +5 Feisty。 2026-03-28 9/450 2026-03-29 12:02 by longlotian
[考研] 本科新能源科学与工程，一志愿华理能动285求调剂 +7 AZMK 2026-03-28 11/550 2026-03-28 21:01 by xxxsssccc
[考研] 压国家一区线，求导师收留，有恩必谢！ +7 迷人的哈哈 2026-03-28 7/350 2026-03-28 16:47 by 催化大白
[考研] 药学105500求调剂 +3 Ssun。。 2026-03-28 3/150 2026-03-28 11:24 by lxf170613
[考研] 一志愿南昌大学324求调剂 +7 hanamiko 2026-03-27 7/350 2026-03-28 09:56 by 李上岸0921
[考研] 081200-314 +3 LILIQQ 2026-03-27 4/200 2026-03-28 09:41 by 保护地球你我做�
[考研] 07化学280分求调剂 +10 722865 2026-03-23 10/500 2026-03-27 15:51 by Plutoqq
[考研] 274求调剂 +17 顾九笙要谦虚 2026-03-24 23/1150 2026-03-27 15:16 by caszguilin
[考研] 333求调剂 +3 question挽风 2026-03-23 3/150 2026-03-27 11:29 by 不吃魚的貓
[考研] 求调剂323材料与化工 +7 1124361 2026-03-24 7/350 2026-03-27 10:22 by wangjy2002
[考研] 276求调剂。有半年电池和半年高分子实习经历 +10 材料学257求调剂 2026-03-23 11/550 2026-03-27 10:13 by YCIT- LHL
[考研] 081200-11408-276学硕求调剂 +3 崔wj 2026-03-26 3/150 2026-03-26 19:57 by nihaoar
[考研] 07化学303求调剂 +5 睿08 2026-03-25 5/250 2026-03-25 22:46 by 418490947
[考研] 332求调剂 +6 032500 2026-03-25 6/300 2026-03-25 22:45 by 418490947
[有机交流] 有机合成求助 20+3 FENGSHUJEI 2026-03-23 5/250 2026-03-24 19:31 by 88817753
[考研] 材料专硕找调剂 +5 哈哈哈吼吼吼哈 2026-03-23 5/250 2026-03-24 19:07 by 了了了了。。
[考研] 336化工调剂 +4 王大坦1 2026-03-23 5/250 2026-03-23 18:32 by allen-yin
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭