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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 【讨论】关于晶格驰豫
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doudouding

木虫 (小有名气)

[交流] 【讨论】关于晶格驰豫

对晶格做驰豫计算，通常是驰豫晶格常数，但在掺杂的情况下做晶格驰豫时，需要固定晶格常数和其他原子位置，而只对掺杂原子坐标进行驰豫计算，这时该怎么设置才能使得其他原子位置也固定不动呢?

看到文献中设置原子坐标是写为（u,u,u）的形式，通过计算得出其中的u值，这个该怎么设置呢？直接输入的时候是只能输入数字的
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1楼 2009-01-27 11:05:51
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zdhlover

荣誉版主 (职业作家)

小木虫之莲花佛
★ ★
qasd(金币+2,VIP+0):xiexie 2-9 11:54
内坐标是相对位置，外坐标是绝对位置，内坐标是分数坐标，外坐标是笛卡尔坐标
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4楼2009-02-09 09:50:56
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css8170

木虫 (正式写手)
★ ★
wuchenwf(金币+2):谢谢讨论 1-29 14:29
MS中可以将需要固定坐标位置的原子选定，在Modify菜单中选择Constraints，出现Edit Constraints对话框，在Atom标签中选择Fix Cartesian position或Fix fractional position即可。
但要注意“只对掺杂原子坐标进行驰豫计算”恐怕是不妥的，应该对掺杂原子周围的一些原子的坐标同时进行驰豫计算。
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2楼2009-01-29 13:53:45
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doudouding

木虫 (小有名气)
看到文献中提到一些晶体原子的内坐标，说到先优化晶胞结构得到晶胞参数然后优化内坐标。这个内坐标的优化是怎么进行的？文献中只是说某个原子的坐标是（u,u,u）,然后优化内坐标，得到u。但在建立晶格结构的时候，原子坐标必须是具体的数字，这个内坐标u的优化是怎么进行的呢？
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3楼2009-02-09 08:50:59
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老虎大王

木虫 (著名写手)
★ ★
qasd(金币+2,VIP+0):xiexie 2-9 11:54
内坐标这个词常用于分子体系。它是用来描述分子的内部运动时所用的坐标系。比如键长，键角，二面角等，这些参数就是内坐标。对于分子，一般不像对无机晶体一样直接讲原子位置坐标。

比如水分子，用两个O-H键长和一个H-O-H键角，这是三个内坐标，就完全描述了这个分子的结构，当然你给出三个原子的位置也是一样的，但一般不是这样描述分子
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5楼2009-02-09 11:31:50
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