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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 程序语言 » Shell&Perl » shell求助---删除特定行中的字符串
汕头大学海洋科学接受调剂
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正版小辉辉

铁虫 (初入文坛)

[求助] shell求助---删除特定行中的字符串

我有如下一个文件：
>S6_1
GTAGGGAATCTTCCGCAATGGACGAAAGTCTAACGGAGCAACAGAAACCCGGGTAGTCC
>S6_2
GTAGGGAATCTTCCGCAATGGACGAAAGTCTAGATACCCGTGTAGTCC
>S6_3
GTAGGGAATCTTCCGCAATGGACGAAAGTCTGTTAGATACCCTAGTAGTCC

我想删除每一行（碱基）中的最后17个字符（AGATACCCTAGTAGTCC），但是不知道用语言如何实现？
貌似用sed和awk比较容易。
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1楼 2017-07-12 22:49:01
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正版小辉辉

铁虫 (初入文坛)
引用回帖:
8楼: Originally posted by ljw4010 at 2017-07-13 11:40:50
sed -i 's/（.*）AGATACCCTAGTAGTCC$/\1/g' filename

qiime@qiime-190-virtual-box:~$ sed -i 's/（.*）ATTAGATACCCTAGTAGTCC$/\1/g' /home/qiime/S1_S14.fasta
sed: -e expression #1, char 36: invalid reference \1 on `s' command's RHS
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9楼2017-07-13 12:19:34
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ljw4010

荣誉版主 (职业作家)

小木虫从头派教主
sed可以搞

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不要说话
2楼2017-07-12 22:53:09
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正版小辉辉

铁虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by ljw4010 at 2017-07-12 22:53:09
sed可以搞

我也明白，可是不会写代码

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3楼2017-07-12 22:56:02
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ljw4010

荣誉版主 (职业作家)

小木虫从头派教主
sed -i 's/AGATACCCTAGTAGTCC//g'   filename

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不要说话
4楼2017-07-13 11:11:39
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