应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 程序语言 » Shell&Perl » shell求助---删除特定行中的字符串
181/2返回列表12下一页
查看: 2375  |  回复: 17
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

正版小辉辉

铁虫 (初入文坛)

[求助] shell求助---删除特定行中的字符串

我有如下一个文件：
>S6_1
GTAGGGAATCTTCCGCAATGGACGAAAGTCTAACGGAGCAACAGAAACCCGGGTAGTCC
>S6_2
GTAGGGAATCTTCCGCAATGGACGAAAGTCTAGATACCCGTGTAGTCC
>S6_3
GTAGGGAATCTTCCGCAATGGACGAAAGTCTGTTAGATACCCTAGTAGTCC

我想删除每一行（碱基）中的最后17个字符（AGATACCCTAGTAGTCC），但是不知道用语言如何实现？
貌似用sed和awk比较容易。
回复此楼

» 猜你喜欢
哈哈
1楼 2017-07-12 22:49:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

ljw4010

荣誉版主 (职业作家)

小木虫从头派教主
前提是每行AGATACCCTAGTAGTCC唯一

发自小木虫Android客户端
赞一下(1人) 回复此楼

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

正版小辉辉
不要说话
5楼2017-07-13 11:12:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通回帖

ljw4010

荣誉版主 (职业作家)

小木虫从头派教主
sed可以搞

发自小木虫Android客户端
回复此楼
不要说话
2楼2017-07-12 22:53:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

正版小辉辉

铁虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by ljw4010 at 2017-07-12 22:53:09
sed可以搞

我也明白，可是不会写代码

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
哈哈
3楼2017-07-12 22:56:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ljw4010

荣誉版主 (职业作家)

小木虫从头派教主
sed -i 's/AGATACCCTAGTAGTCC//g'   filename

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
不要说话
4楼2017-07-13 11:11:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

正版小辉辉

铁虫 (初入文坛)
送红花一朵
引用回帖:
5楼: Originally posted by ljw4010 at 2017-07-13 11:12:27
前提是每行AGATACCCTAGTAGTCC唯一

但是如果不一样呢？这样是不是就不好办了？
赞一下 回复此楼
哈哈
6楼2017-07-13 11:28:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ljw4010

荣誉版主 (职业作家)

小木虫从头派教主
不一样就这么搞，分组正则，我没验过，你试下，sed -i 's/（.*）AGATACCCTAGTAGTCC$/\1/g'? ?filename

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
不要说话
7楼2017-07-13 11:39:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ljw4010

荣誉版主 (职业作家)

小木虫从头派教主
sed -i 's/（.*）AGATACCCTAGTAGTCC$/\1/g' filename

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
不要说话
8楼2017-07-13 11:40:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

正版小辉辉

铁虫 (初入文坛)
引用回帖:
8楼: Originally posted by ljw4010 at 2017-07-13 11:40:50
sed -i 's/（.*）AGATACCCTAGTAGTCC$/\1/g' filename

qiime@qiime-190-virtual-box:~$ sed -i 's/（.*）ATTAGATACCCTAGTAGTCC$/\1/g' /home/qiime/S1_S14.fasta
sed: -e expression #1, char 36: invalid reference \1 on `s' command's RHS
赞一下 回复此楼
哈哈
9楼2017-07-13 12:19:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

正版小辉辉

铁虫 (初入文坛)
引用回帖:
9楼: Originally posted by 正版小辉辉 at 2017-07-13 12:19:34
qiime@qiime-190-virtual-box:~$ sed -i 's/（.*）ATTAGATACCCTAGTAGTCC$/\1/g' /home/qiime/S1_S14.fasta
sed: -e expression #1, char 36: invalid reference \1 on `s' command's RHS...

这样看起来，有错误出现
赞一下 回复此楼
哈哈
10楼2017-07-13 12:20:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 正版小辉辉 的主题更新
181/2返回列表12下一页
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[公派出国] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 ELBZ6WwEaRj6 2026-11-05 4/200 2026-11-06 02:37 by qL1cU46YIdK0
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 ELBZ6WwEaRj6 2026-11-05 7/350 2026-11-06 02:35 by qL1cU46YIdK0
[考博] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 ELBZ6WwEaRj6 2026-11-04 10/500 2026-11-06 02:24 by qL1cU46YIdK0
[硕博家园] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +4 ELBZ6WwEaRj6 2026-11-04 8/400 2026-11-06 02:24 by qL1cU46YIdK0
[基金申请] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +4 ELBZ6WwEaRj6 2026-11-04 10/500 2026-11-06 02:24 by qL1cU46YIdK0
[公派出国] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 ELBZ6WwEaRj6 2026-11-04 9/450 2026-11-06 02:15 by qL1cU46YIdK0
[公派出国] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 7/350 2026-11-06 02:13 by qL1cU46YIdK0
[考博] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +4 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 7/350 2026-11-06 02:13 by qL1cU46YIdK0
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +4 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 10/500 2026-11-06 02:04 by qL1cU46YIdK0
[考研] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 13/650 2026-11-06 02:02 by qL1cU46YIdK0
[硕博家园] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 8/400 2026-11-06 02:02 by qL1cU46YIdK0
[考博] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +4 kvewwGtKktqB 2026-11-04 10/500 2026-11-06 01:51 by qL1cU46YIdK0
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +6 kvewwGtKktqB 2026-11-04 15/750 2026-11-06 01:51 by qL1cU46YIdK0
[公派出国] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +6 ncTVBM6AOJHF 2026-11-04 10/500 2026-11-06 01:31 by qL1cU46YIdK0
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +5 ncTVBM6AOJHF 2026-11-04 11/550 2026-11-06 01:20 by qL1cU46YIdK0
[考博] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 ELBZ6WwEaRj6 2026-11-05 4/200 2026-11-05 23:39 by qL1cU46YIdK0
[考研] 售SCI一区文章，我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +3 ELBZ6WwEaRj6 2026-11-04 9/450 2026-11-05 23:17 by qL1cU46YIdK0
[公派出国] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +5 kvewwGtKktqB 2026-11-04 13/650 2026-11-05 22:55 by qL1cU46YIdK0
[公派出国] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +5 ncTVBM6AOJHF 2026-11-04 13/650 2026-11-05 22:44 by qL1cU46YIdK0
[基金申请] 各位基础老师们，看完中央《从严治党》的决定后，对学术界更加有信心了吧 +5 iaeyuan 2026-11-01 5/250 2026-11-04 14:43 by jinchengzi
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭