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Gromacs中MDP文件的设置
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在一篇文献中看到关于MDP文件的设置，哪位达人知道如何设置？ 1.SETTLE algorithm in the case of water molecules 2.To maintain a constant temperature and pressure for various components during simulations, the Brendsen coupling algorithm was used for each component of the system with relaxation times of 0.1 and 0.5 ps, respectively. 3.In this algorithm every atom interacts with all atoms in the simulation box and all of their images in an infinite number of identical copies surrounding the main box。 |
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