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小木虫论坛-学术科研互动平台» 网络生活区» 有奖问答 » 有奖问答完结子版 » Gromacs中MDP文件的设置
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xsfh

木虫 (小有名气)

[交流] Gromacs中MDP文件的设置

在一篇文献中看到关于MDP文件的设置，哪位达人知道如何设置？


1.SETTLE algorithm  in the case of water molecules

2.To maintain a constant temperature and pressure for various components during simulations, the Brendsen coupling algorithm was used for each component of the system with relaxation times of 0.1 and 0.5 ps, respectively.


3.In this algorithm every atom interacts with all atoms in the simulation box and all of their images in an infinite number of identical copies surrounding the main box。
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1楼 2009-01-22 08:26:50
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蒋代忠

木虫 (小有名气)
没有用过，不知道
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7楼2009-01-22 15:16:45
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mltragassi

金虫 (正式写手)
★ ★
xsfh(金币+2):谢谢！ 1-22 15:54
1。调整好在一定条件下的水分子的参数
2。在模拟器的各个组分上保持一个恒定的温度和压力，Brendsen耦合算法分别用于 每个组件在0.1和0.5ps张弛速度的系统
3。在测试计算时各组成部分保持一个恒定的温度和压力。
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4楼2009-01-22 09:35:36
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mltragassi

金虫 (正式写手)
只能这样了了~~~有些话不知道怎么组合成中文~~呵呵，水平有限！
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5楼2009-01-22 09:36:33
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孤独的鱼

金虫 (正式写手)
不能帮忙，支持下
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6楼2009-01-22 14:28:31
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