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新虫 (初入文坛)

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[求助] 基因克隆全长已有1人参与

本人没有做过分子相关的实验，但导师突然叫我做个基因克隆（是做基因全长），作为毕业论文的一部分。但是我现在第一步就不知道怎么做了(请各位帮我一下），我有在NCBI里找该基因(我是克隆鱼的DDB1基因)序列，但是发现只有部分物种有这个基因的序列，而且这些物种同源性不高，我该怎么做？希望各位大牛帮我解答一下！

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1楼 2017-07-04 07:41:52

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mayunhui

新虫 (正式写手)

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是从基因组中克隆还是从cDNA中克隆？

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书到用时方恨少

2楼2017-07-05 11:13:03

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晋鹏

版主 (知名作家)

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【答案】应助回帖

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西门吹雪170: 金币+3, 鼓励回帖交流 2017-07-06 12:32:08

1、首先，你应该改变你的认识“只有部分物种有这个基因的序列，而且这些物种同源性不高”，如果都被研究透彻了，那你做这个工作的创新点在哪里呢？

2、既然你需要“克隆鱼的DDB1基因”，检索NCBI，目前已经克隆报道的DDB1基因有169个，包括动物、植物和微生物。

3、研究对象为鱼，可以以斑马鱼为例啊，已报道的斑马鱼DDB1基因有3个：

ID: 393599
damage-specific DNA binding protein 1 [Danio rerio (zebrafish)] Chromosome 18, NC_007129.7 (50826591..50839096, complement) zgc:63840

ID: 449848
X-ray repair complementing defective repair in Chinese hamster cells 5 [Danio rerio (zebrafish)] Chromosome 9, NC_007120.7 (52558181..52597667, complement) Ku80, im:7137560, si:ch211-239d11.4

ID: 100004133
damage-specific DNA binding protein 2 [Danio rerio (zebrafish)] Chromosome 18, NC_007129.7 (20468151..20479334) si:dkey-45f10.3

建议以Gene ID: 393599，为同源模板，设计引物，克隆即可。

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及时行乐，人生不留遗憾！

3楼2017-07-06 10:18:42

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