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呆--呆

新虫 (初入文坛)

[求助] 表面吸附小分子问题。。。 已有1人参与

用MS进行吸附建模,如何进行表面弛豫,表面吸附小分子需要进行成键么还是直接将分子直接放在表面??求助大神啊。。
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clickme

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
呆--呆: 金币+10 2017-06-24 20:17:54
吸附分子距离表面2A多一点比较合适,可进就化学吸附成键,可退就成物理吸附。

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
2楼2017-06-24 12:09:42
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呆--呆

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by clickme at 2017-06-24 12:09:42
吸附分子距离表面2A多一点比较合适,可进就化学吸附成键,可退就成物理吸附。

化学吸附成键怎么操作,能不能留个QQ请教一下。。。谢谢了。。。
3楼2017-06-24 15:59:38
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clickme

木虫 (小有名气)

你设定好初始构型优化即可。能吸附就会有化学键,不能吸附就被弹开。

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
4楼2017-06-24 16:37:51
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clickme

木虫 (小有名气)

你设定好初始构型优化即可。能吸附就会有化学键,不能吸附就被弹开。

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
5楼2017-06-24 16:46:25
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呆--呆

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by clickme at 2017-06-24 12:09:42
吸附分子距离表面2A多一点比较合适,可进就化学吸附成键,可退就成物理吸附。

化学吸附成键怎么操作,能不能留个QQ请教一下。。。谢谢了。。。
6楼2017-06-24 18:50:15
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呆--呆

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
5楼: Originally posted by clickme at 2017-06-24 16:46:25
你设定好初始构型优化即可。能吸附就会有化学键,不能吸附就被弹开。

现在还有一个问题我切出了晶体110面并且把表面的氧去掉然后再做优化,优化的结果是表面结构直接跑出来了。。。你知道怎么解决么,大神。。。
7楼2017-06-24 20:23:05
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clickme

木虫 (小有名气)

引用回帖:
7楼: Originally posted by 呆--呆 at 2017-06-24 20:23:05
现在还有一个问题我切出了晶体110面并且把表面的氧去掉然后再做优化,优化的结果是表面结构直接跑出来了。。。你知道怎么解决么,大神。。。...

优化后出来的问题,试试右键 display style -> lattice -> style 选 original
另外,氧化物切面后最好让氧封端,不要让金属原子直接暴露,这样不符合实验情况。
8楼2017-06-24 21:55:19
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呆--呆

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
8楼: Originally posted by clickme at 2017-06-24 21:55:19
优化后出来的问题,试试右键 display style -> lattice -> style 选 original
另外,氧化物切面后最好让氧封端,不要让金属原子直接暴露,这样不符合实验情况。...

试了一下你说那种方法还是不行,还是在外面,我在想是不是和束缚有关,但我又不知道怎么做。。
9楼2017-06-25 10:27:52
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