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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 表面吸附小分子问题。。。
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呆--呆

新虫 (初入文坛)

[求助] 表面吸附小分子问题。。。 已有1人参与

用MS进行吸附建模，如何进行表面弛豫，表面吸附小分子需要进行成键么还是直接将分子直接放在表面？？求助大神啊。。
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1楼 2017-06-24 09:27:53
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clickme

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
呆--呆: 金币+10 2017-06-24 20:17:54
吸附分子距离表面2A多一点比较合适，可进就化学吸附成键，可退就成物理吸附。

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2楼2017-06-24 12:09:42
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呆--呆

新虫 (初入文坛)
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2楼: Originally posted by clickme at 2017-06-24 12:09:42
吸附分子距离表面2A多一点比较合适，可进就化学吸附成键，可退就成物理吸附。

化学吸附成键怎么操作，能不能留个QQ请教一下。。。谢谢了。。。
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3楼2017-06-24 15:59:38
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clickme

木虫 (小有名气)
你设定好初始构型优化即可。能吸附就会有化学键，不能吸附就被弹开。

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4楼2017-06-24 16:37:51
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clickme

木虫 (小有名气)
你设定好初始构型优化即可。能吸附就会有化学键，不能吸附就被弹开。

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5楼2017-06-24 16:46:25
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呆--呆

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by clickme at 2017-06-24 12:09:42
吸附分子距离表面2A多一点比较合适，可进就化学吸附成键，可退就成物理吸附。

化学吸附成键怎么操作，能不能留个QQ请教一下。。。谢谢了。。。
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6楼2017-06-24 18:50:15
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呆--呆

新虫 (初入文坛)
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5楼: Originally posted by clickme at 2017-06-24 16:46:25
你设定好初始构型优化即可。能吸附就会有化学键，不能吸附就被弹开。

现在还有一个问题我切出了晶体110面并且把表面的氧去掉然后再做优化，优化的结果是表面结构直接跑出来了。。。你知道怎么解决么，大神。。。
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7楼2017-06-24 20:23:05
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clickme

木虫 (小有名气)
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7楼: Originally posted by 呆--呆 at 2017-06-24 20:23:05
现在还有一个问题我切出了晶体110面并且把表面的氧去掉然后再做优化，优化的结果是表面结构直接跑出来了。。。你知道怎么解决么，大神。。。...

优化后出来的问题，试试右键 display style -> lattice -> style 选 original
另外，氧化物切面后最好让氧封端，不要让金属原子直接暴露，这样不符合实验情况。
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8楼2017-06-24 21:55:19
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呆--呆

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
8楼: Originally posted by clickme at 2017-06-24 21:55:19
优化后出来的问题，试试右键 display style -> lattice -> style 选 original
另外，氧化物切面后最好让氧封端，不要让金属原子直接暴露，这样不符合实验情况。...

试了一下你说那种方法还是不行，还是在外面，我在想是不是和束缚有关，但我又不知道怎么做。。
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9楼2017-06-25 10:27:52
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