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桂桂5708

木虫 (著名写手)

[求助] 总RNA提取效率是否会影响后面的Ct值? 已有1人参与

如题,做荧光定量PCR实验,在血清样本中加入一定量的拟南芥,如果提取效率低的话,是否会影响它的Ct值呢?如果提取后的总RNA的纯度和总量不是那么好,那些存在的盐类和蛋白也会影响结果吗?谢谢~~~~~~~~~~~~
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慷慨丈夫志,生当忠孝门,为官须做相,及第必争先.
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吕玉平

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2017-06-19 11:53:49
会有影响的,RNA的浓度影响最后PCR反应中的模板质量,进而影响反应效率,影响CT值的因素之一就是PCR反应效率。
每天的目标就是过的充实
10楼2017-06-16 11:03:44
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MulanQahar

金虫 (正式写手)

1. 没明白提取效率低的意思。2. 纯度不好的时候,肯定会受影响。但是浓度低的时候,未必会。

发自小木虫Android客户端
2楼2017-06-15 15:48:03
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MulanQahar

金虫 (正式写手)

在纯度低的时候,因为存在基因组D你A的污染,

发自小木虫Android客户端
3楼2017-06-15 16:00:12
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MulanQahar

金虫 (正式写手)


西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2017-06-19 11:53:28
DNA 的污染,会出现很多的非特异性的扩增。因而影响Ct value.

发自小木虫Android客户端
4楼2017-06-15 16:02:49
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ocean_of_yu

木虫 (正式写手)

Cool

引用回帖:
5楼: Originally posted by 桂桂5708 at 2017-06-15 16:34:05
因为在提取后,RNA的浓度还不到10ng/ul,A260/280才1.0左右。...

这个浓度建议重新提取
6楼2017-06-15 16:42:55
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普通回帖

桂桂5708

木虫 (著名写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by MulanQahar at 2017-06-15 15:48:03
1. 没明白提取效率低的意思。2. 纯度不好的时候,肯定会受影响。但是浓度低的时候,未必会。

因为在提取后,RNA的浓度还不到10ng/ul,A260/280才1.0左右。
慷慨丈夫志,生当忠孝门,为官须做相,及第必争先.
5楼2017-06-15 16:34:05
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MulanQahar

金虫 (正式写手)

引用回帖:
5楼: Originally posted by 桂桂5708 at 2017-06-15 16:34:05
因为在提取后,RNA的浓度还不到10ng/ul,A260/280才1.0左右。...

重新做吧。

发自小木虫Android客户端
7楼2017-06-15 21:11:18
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匿名

用户注销 (正式写手)

本帖仅楼主可见
8楼2017-06-15 21:17:58
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sherlock0088

金虫 (小有名气)

9楼2017-06-16 10:22:26
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