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方少贤

铁杆木虫 (小有名气)

迟钝的先知

[求助] 在ncbi上如何通过blast的结果判断目的基因序列的种属? 已有1人参与

我提了未知真菌的基因,用ITS引物进行扩增,后送去测序,得到的序列在ncbi网站上进行blast,然后结果出来后如何从这些对比中来确定种属,如下图,我如何从这几个参数中确定?哪个参数最重要最具参考价值?请虫友帮忙解答,谢谢!

在ncbi上如何通过blast的结果判断目的基因序列的种属?
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事在人为
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方少贤

铁杆木虫 (小有名气)

迟钝的先知

引用回帖:
8楼: Originally posted by 小冀- at 2017-06-06 14:18:22
E-value是0,iden是100或者99的话,估计就可以确定了~...

如果ident值不是那么高,该如何分析跟哪个物种更相近呢,怎么结合这几项指标去分析?
事在人为
9楼2017-06-07 17:06:26
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2楼2017-06-05 18:02:57
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不懂事的我

新虫 (正式写手)


小冀-: 金币+1, 鼓励回帖交流 2017-06-06 08:55:10
比对结果的第一个参考价值比较大,差不服就相近物种

发自小木虫Android客户端
3楼2017-06-06 08:51:54
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小冀-

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【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
方少贤: 金币+7, ★★★很有帮助 2017-06-07 09:37:37
看E-value值和总分,E-value值相当小,总分99或者100的基本上可以认为是同一个种属的了
···
4楼2017-06-06 08:54:55
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