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miRNA荧光定量pcr,跪求大神指点! 已有1人参与
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研究内容是实验组感染病毒后,realtime检测细胞中miRNA表达有无变化。 已经卡了三个月了,毫无进展,十分绝望。 1.最开始用人的原代T细胞和其他两种T细胞系来做,u6为内参,引物均为广州锐博生物订购的茎环引物。然而实验结果有一个很严重的问题就是u6的ct值极不稳定,甚至倾向于随病毒感染上调的趋势,无法定量其他miRNA的表达。 但找了大量文献,并且组内讨论认为"实验因素引起u6变化"的可能性微乎其微。 2.随后继续在T细胞系里验证,同时将GAPDH也作为内参,结果显示gapdh在细胞间稳定,而u6继续不稳定。 3.以上结果均在abi 7500测得,所有miRNA和u6从逆转录一步就使用特异茎环引物,逆转录的RNA模板均为2ug;罗氏Mix;u6 cDNA稀释100倍,其余cDNA稀释5倍。 4.这个月换了贴壁细胞来做,之前做过预实验结果和T细胞中一致,实验组u6的ct值都会变小;然而适逢7500热盖坏了,就去借用公用的abi stepone plus来跑realtime.可是现在的问题是换了仪器完全做不出来了?实验程序、体系都没变…前两次跑完全没有扩增曲线,跑胶也确实无扩增,今天事先做了普通pcr检测有产物才拿去做realtime,我调了调基线阈值,好歹有一些孔有数值了,但是数值非常随机毫无规律…比如我做了4个复孔,ct能达到19和38的差异…完全绝望…这到底是我的问题还是stepone和7500哪里不同… 每天都重振旗鼓调整实验找问题,但是每天都毫无结果…金币不多跪求师兄师姐们指点… 附今日的扩增曲线图… @biostar2009 发自小木虫Android客户端 |
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