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921293056

银虫 (初入文坛)

[求助] 琼脂糖凝胶电泳结果分析,跪求原因

提取出的DNA浓度测量了一下是200-300ng/ul,温度梯度PCR以后的电泳图是这样的,第一行和第二行是不同类型的基因。Marker是右边的一排。

琼脂糖凝胶电泳结果分析,跪求原因


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金平果

新虫 (著名写手)

分析什么原因,拖带吗?

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2楼2017-05-23 22:37:06
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921293056

银虫 (初入文坛)

送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by 金平果 at 2017-05-23 22:37:06
分析什么原因,拖带吗?

温度梯度50到62度,条带都不清楚,不知道最适合的退火温度

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3楼2017-05-23 23:39:53
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921293056

银虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 金平果 at 2017-05-23 22:37:06
分析什么原因,拖带吗?

这个结果能用吗?第一次做,还是小菜鸟一枚,望高手指点

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4楼2017-05-23 23:43:01
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金平果

新虫 (著名写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 921293056 at 2017-05-23 23:39:53
温度梯度50到62度,条带都不清楚,不知道最适合的退火温度
...

DNA提取多长时间,是不是降解;模板加多少;

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5楼2017-05-24 08:57:52
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921293056

银虫 (初入文坛)

引用回帖:
5楼: Originally posted by 金平果 at 2017-05-24 08:57:52
DNA提取多长时间,是不是降解;模板加多少;
...

DNA提取3周,体系是50ul,模版加15ng。我稀释成1.5ng/ul,然后加了10ul。94度预变性3分钟,94度变性30秒,退火50到64度30秒,72度延伸1分钟

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6楼2017-05-24 09:07:00
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金平果

新虫 (著名写手)


西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2017-05-25 07:42:34
退火温度试一下55℃,你50-62℃每一个温梯是多少?2℃吗?在看一下你基因大小,延伸时间调整一下

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7楼2017-05-24 09:25:45
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921293056

银虫 (初入文坛)

送红花一朵
引用回帖:
7楼: Originally posted by 金平果 at 2017-05-24 09:25:45
退火温度试一下55℃,你50-62℃每一个温梯是多少?2℃吗?在看一下你基因大小,延伸时间调整一下

从左到右温度依次增加,我的目的片段大概就100到300bp。延伸温度是按照说明书上写着1kb/min。延伸温度要怎么调整呢?
琼脂糖凝胶电泳结果分析,跪求原因-1



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8楼2017-05-24 23:38:15
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xinxiyuzhou

至尊木虫 (著名写手)

首先,你这个基因是真核还是原核的?要是原核的可以直接做pcr,如果是真核的,要提RNA,逆转录,然后再PCR。退火温度跟引物设计有关,引物退火温度上下10度都可以。一般情况下,56度,或者58度,低到52度,高到60度,这四个温度都可以,不用设计温度梯度梯度。退火温度越高,特异性越高,理论上条带越单一。酶也会影响结果。你的PCR的体系贴出来看看。延伸一般是1kb1min都没有问题。你的目的片段大小是多少?在问问题的时候这些都要讲清楚,不然根本就找不到原因。

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9楼2017-05-25 10:12:23
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