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fu_jian2008金虫 (著名写手)
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[求助]
大伙在做docking的时候recepter（受体）选择用单独酶的PDB，底物的PDB已有1人参与
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如题，最近小弟遇到一个问题，因为我做docking的这个酶有好几个PDB。然后我主要很困惑到底是用酶的PDB，还是用酶和底物的复合物的PDB作为recepter。哪个用来作为recepter会更好呢，还是有区别呢。请老司机版帮忙解惑。我不知道表达的清楚不？ 还有大家都是用什么软件把chemdraw里的平面结构转换成可以docking的3D结构的呢？ 还望不吝赐教，谢谢  |
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3楼2017-05-13 10:26:09
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回答你问题，能力有限，仅供参考：1，受体的问题，在同等条件下尽量选择含配体的蛋白，方便确定对接位置；2，一般来说chemdraw画好的结构可以直接用对接软件读入的，就是说大部分情况下不用转换了。 发自小木虫Android客户端 |
2楼2017-05-13 06:38:30