24小时热门版块排行榜    

查看: 2097  |  回复: 11
当前主题已经存档。
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

1yangz

新虫 (初入文坛)


[交流] 关于质粒载体,引物设计,及重组连接

我因为要扩增出一段目的基因并转入PNZ8112载体
现在关于PCR扩增目的基因的引物设计有些迷惑
本人纯属菜鸟,祈望各路大侠不吝赐教

载体图谱如下:


该载体我有些看不懂
1)repC, repA,cm ,Pnis,ssUSP,His, T分别是什么意思?
2)内圈里面的红色箭头是什么意思?指互补链么?
3)为什么右上方用绿色标识?是特指那段是多克隆位点吗?还有绿色中间还有一小段黑色的?在T的位置怎么还有个蓝色的框?

我的目的片段与该载体都有以下三个酶切位点:NaeI, speI , XmnI
是说我在设计引物的时候不可以用以上这三个克隆为点么!?
还麻烦各路英雄帮我看看我的目的基因插入在哪两个酶切为点之间比较合适!
我的目的片段是1134bp的
是不是大于600的就不好扩或者是说扩增效率很低?


我这个载体是专门转化乳酸乳球菌的特异性载体
现在只能用以下这两个酶切位点“kpnI”和“XbaI”了
现在有疑问
我本来对设计引物的思路还是比较清晰
结果后来是越看越糊涂

我的目的基因是UreB,菌株是幽门螺杆菌“ss1”
一个是希望大家给我提提一件
再一个是看看有没有高人给我看看我这个实验的可行性怎么样
谢谢

[ Last edited by 1yangz on 2009-1-10 at 21:39 ]
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wjswj

木虫 (正式写手)

小木虫领金币专业户

★
lwf991229(金币+1,VIP+0):3Q,感谢参与讨论~~
尿素酶啊,呵呵,试试吧。把KpnI的识别序列放在上游引物的5'端,加好保护碱基,确认编码框正确。XbaI的识别序列加在下游引物的5'端,同样保护好。PCR出来后纯化或抽提一下然后能双切就双切,不能的话就单切,抽提/纯化,然后再用另一个酶单切,然后连接转化,ok了。然后酶切、测序鉴定一下筛选出来的克隆子,至于以后表达什么的就要看你是不是继续做了。以前用大肠杆菌表达过尿素酶,不过没有活性,呵呵。
金币是赌出来的
12楼2009-01-12 08:57:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 12 个回答

snzydong

铁杆木虫 (著名写手)

★
lwf991229(金币+1,VIP+0):感谢参与讨论~~
内圈里面的红色箭头 表示方向
我的目的片段与该载体都有以下三个酶切位点:NaeI, speI , XmnI
是说我在设计引物的时候不可以用以上这三个克隆为点么  是的不可以用 否则片段也切开了
要看你用什么公司的酶 只要选择公用buffer的就可以双酶切了
2楼2009-01-08 10:38:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

1yangz

新虫 (初入文坛)


引用回帖:
Originally posted by snzydong at 2009-1-8 10:38:
内圈里面的红色箭头 表示方向
我的目的片段与该载体都有以下三个酶切位点:NaeI, speI , XmnI
是说我在设计引物的时候不可以用以上这三个克隆为点么  是的不可以用 否则片段也切开了
要看你用什么公司的酶 只 ...

谢谢!
3楼2009-01-08 11:16:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

study236

银虫 (小有名气)

你可以用简单载体即不带有酶切位点的载体,然后设计引物时,添加上酶切位点和保护碱基
4楼2009-01-08 13:42:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 GxESXJmptOtQ 2026-09-25 4/200 2026-09-27 06:42 by XgCC8uTcwILl
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 GxESXJmptOtQ 2026-09-25 4/200 2026-09-27 06:39 by XgCC8uTcwILl
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 GxESXJmptOtQ 2026-09-25 3/150 2026-09-27 06:32 by XgCC8uTcwILl
[找工作] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 vQZoDrrm7mUF 2026-09-25 3/150 2026-09-27 06:08 by XgCC8uTcwILl
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +3 vQZoDrrm7mUF 2026-09-25 3/150 2026-09-27 06:05 by XgCC8uTcwILl
[硕博家园] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 vQZoDrrm7mUF 2026-09-25 4/200 2026-09-27 05:56 by XgCC8uTcwILl
[论文投稿] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +4 vQZoDrrm7mUF 2026-09-25 4/200 2026-09-27 05:56 by XgCC8uTcwILl
[考研] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 vQZoDrrm7mUF 2026-09-25 3/150 2026-09-27 05:56 by XgCC8uTcwILl
[找工作] 售SCI一区文章,我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +5 vQZoDrrm7mUF 2026-09-25 5/250 2026-09-27 05:53 by XgCC8uTcwILl
[博后之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +4 vQZoDrrm7mUF 2026-09-25 4/200 2026-09-27 05:50 by XgCC8uTcwILl
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +3 vQZoDrrm7mUF 2026-09-25 5/250 2026-09-27 05:44 by XgCC8uTcwILl
[考博] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 vQZoDrrm7mUF 2026-09-25 3/150 2026-09-27 05:44 by XgCC8uTcwILl
[公派出国] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 vQZoDrrm7mUF 2026-09-25 4/200 2026-09-27 05:44 by XgCC8uTcwILl
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +3 vQZoDrrm7mUF 2026-09-25 6/300 2026-09-27 05:42 by XgCC8uTcwILl
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +4 PGTSwSC3F6nQ 2026-09-24 5/250 2026-09-25 11:19 by yhq9807
[公派出国] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 PGTSwSC3F6nQ 2026-09-24 7/350 2026-09-25 11:18 by yhq9807
[硕博家园] 上海工程技术大学 激光智能制造课题组 2027级博士研究生招生 +4 oxidpl 2026-09-20 6/300 2026-09-24 20:40 by oxidpl
[教师之家] 课题组招2027级博士 上海工程技术大学 激光智能制造方向 +4 oxidpl 2026-09-20 6/300 2026-09-24 20:37 by oxidpl
[基金申请] 师弟论文见刊大半年才想起来申请专利,还能抢救一下吗? +4 13108017953 2026-09-21 4/200 2026-09-24 10:06 by kudofaye
[有机交流] 有机合成以后会不会被AI改变?做科研的虫友怎么看 +5 zapen 2026-09-20 8/400 2026-09-23 17:21 by tianxiaoxian
信息提示
请填处理意见