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异域郑

新虫 (小有名气)

[求助] 蛋白的系统发育树分析 已有2人参与

做出了发育树,但是如何分析,求大神指教

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Real000Lee

新虫 (初入文坛)

这要看你用的什么方法做的树了,NJ,MP,ML,BI等等基于的算法不同解释肯定略有差异,这个你可以仿照你看到的文献做解释嘛。总体上构成姊妹支的肯定结构相似度越高,结合你想说明的问题解释就可以了

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2楼2017-05-06 17:01:48
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异域郑

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by Real000Lee at 2017-05-06 17:01:48
这要看你用的什么方法做的树了,NJ,MP,ML,BI等等基于的算法不同解释肯定略有差异,这个你可以仿照你看到的文献做解释嘛。总体上构成姊妹支的肯定结构相似度越高,结合你想说明的问题解释就可以了
...

我用的MEGA5.

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3楼2017-05-06 20:45:37
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Real000Lee

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
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3楼: Originally posted by 异域郑 at 2017-05-06 20:45:37
我用的MEGA5.
...

我是问具体作的哪种树?我用的mega7,跟5本质差不多,界面友好一些

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4楼2017-05-06 21:02:39
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Real000Lee

新虫 (初入文坛)

5楼2017-05-06 21:07:55
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Real000Lee

新虫 (初入文坛)

蛋白的话一般是想看功能吧?那么可以选一些已知功能的同源蛋白跟你的序列一起构树,聚在一起的可能在结构功能上更接近,要么是遗传关系近,要么是趋同进化结果

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6楼2017-05-06 21:10:33
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Real000Lee

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

引用回帖:
6楼: Originally posted by Real000Lee at 2017-05-06 21:10:33
蛋白的话一般是想看功能吧?那么可以选一些已知功能的同源蛋白跟你的序列一起构树,聚在一起的可能在结构功能上更接近,要么是遗传关系近,要么是趋同进化结果

分析只是针对树图的拓扑结构进行看图说话,想解释的精彩还是要联系你的研究对象和想解决的问题啊

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7楼2017-05-06 21:12:48
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