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gzesxx

木虫 (小有名气)

[交流] 求助CIF 中B,C类错误的解决办法

check时有如下错误,请问怎么解决, 谢谢

           Absorption correction given as Not Given
STRVA01_ALERT_2_C           Chirality of atom sites is inverted?
           From the CIF: _refine_ls_abs_structure_Flack    0.990
           From the CIF: _refine_ls_abs_structure_Flack_su    0.020

PLAT232_ALERT_2_C Hirshfeld Test Diff (M-X)  Cu1    --  O2      ..     6.99 su   
PLAT232_ALERT_2_C Hirshfeld Test Diff (M-X)  Cu1    --  O5      ..       7.16 su  

PLAT241_ALERT_2_C Check High      Ueq as Compared to Neighbors for         O5   
     
PLAT033_ALERT_4_C Flack Parameter Value Deviates from Zero ...  0.99
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maomao11259

木虫 (小有名气)

请问,用指令
ELMU cu1 O5 cu1 O2
SIMU 0.001 0.001 cu1 O5 cu1 O2
为什么出错,应该在那个文件中输入,并保持为那种文件才不会出错(我用wingx解)
谢谢


ins中输入这些口令
你的口令输入有误。
不是固定键长,所以delu后面跟上误差以及原子就可以了。
9楼2009-01-07 15:15:35
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xi2004

至尊木虫 (职业作家)


waiy2001(金币+1,VIP+0):
refine_ls_abs_structure_Flack    0.990
表明绝对构型搞反了?

其他都是常见错误嘛.
xi2004-emuch@163.com
2楼2009-01-06 23:46:02
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gzesxx

木虫 (小有名气)

我也认为绝对构型反了,用命令 move 1 1 1 -1 修了后,C类错误:PLAT232_ALERT_2_C Hirshfeld Test Diff (M-X)  Cu1    --  O2      ..     6.99 su   
PLAT232_ALERT_2_C Hirshfeld Test Diff (M-X)  Cu1    --  O5      ..       7.16 su  
变为了B类错误:
PLAT232_ALERT_2_C Hirshfeld Test Diff (M-X)  Cu1    --  O2      ..     12.31 su   
PLAT232_ALERT_2_C Hirshfeld Test Diff (M-X)  Cu1    --  O5      ..       13.16  su  

请问用什么指令消去这个B类错误,谢谢。
3楼2009-01-07 10:00:22
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xi2004

至尊木虫 (职业作家)


warlen(金币+1,VIP+0):多谢热心应助!
有时候不一定要消除C类错误.
无关紧要.

另外, 首先考虑Cu是不是Cu.
xi2004-emuch@163.com
4楼2009-01-07 10:18:00
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