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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 材料区 » 晶体 » CIF专栏 » 求助CIF 中B,C类错误的解决办法
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gzesxx

木虫 (小有名气)

[交流] 求助CIF 中B,C类错误的解决办法

check时有如下错误，请问怎么解决, 谢谢

           Absorption correction given as Not Given
STRVA01_ALERT_2_C           Chirality of atom sites is inverted?
           From the CIF: _refine_ls_abs_structure_Flack    0.990
           From the CIF: _refine_ls_abs_structure_Flack_su    0.020

PLAT232_ALERT_2_C Hirshfeld Test Diff (M-X)  Cu1    --  O2      ..     6.99 su   
PLAT232_ALERT_2_C Hirshfeld Test Diff (M-X)  Cu1    --  O5      ..       7.16 su  

PLAT241_ALERT_2_C Check High      Ueq as Compared to Neighbors for         O5   
     
PLAT033_ALERT_4_C Flack Parameter Value Deviates from Zero ...  0.99
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1楼 2009-01-06 23:30:06
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xi2004

至尊木虫 (职业作家)
★
waiy2001(金币+1,VIP+0):
refine_ls_abs_structure_Flack    0.990
表明绝对构型搞反了?

其他都是常见错误嘛.
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xi2004-emuch@163.com
2楼2009-01-06 23:46:02
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gzesxx

木虫 (小有名气)
我也认为绝对构型反了，用命令 move 1 1 1 -1 修了后，C类错误：PLAT232_ALERT_2_C Hirshfeld Test Diff (M-X)  Cu1    --  O2      ..     6.99 su   
PLAT232_ALERT_2_C Hirshfeld Test Diff (M-X)  Cu1    --  O5      ..       7.16 su  
变为了B类错误：
PLAT232_ALERT_2_C Hirshfeld Test Diff (M-X)  Cu1    --  O2      ..     12.31 su   
PLAT232_ALERT_2_C Hirshfeld Test Diff (M-X)  Cu1    --  O5      ..       13.16  su  

请问用什么指令消去这个B类错误，谢谢。
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3楼2009-01-07 10:00:22
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xi2004

至尊木虫 (职业作家)
★
warlen(金币+1,VIP+0):多谢热心应助！
有时候不一定要消除C类错误.
无关紧要.

另外, 首先考虑Cu是不是Cu.
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xi2004-emuch@163.com
4楼2009-01-07 10:18:00
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gzesxx

木虫 (小有名气)
请问xi2004：

PLAT232_ALERT_2_C Hirshfeld Test Diff (M-X)  Cu1    --  O2      ..     12.31 su   
PLAT232_ALERT_2_C Hirshfeld Test Diff (M-X)  Cu1    --  O5      ..       13.16  su  

成为B类错误了，请问该怎么办

谢谢。
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5楼2009-01-07 11:58:12
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gzesxx

木虫 (小有名气)
而且原子Cu肯定没错
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6楼2009-01-07 11:59:08
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xi2004

至尊木虫 (职业作家)
★
waiy2001(金币+1,VIP+0):
如果肯定没错, 那就用点delu指令
比如
delu 0.001 cu1 o2
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xi2004-emuch@163.com
7楼2009-01-07 12:04:47
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gzesxx

木虫 (小有名气)
用了指令：
delu   0.001 CU1 O2
delu   0.001 CU1 O5
还是不行，出现如下错误：
Alert level B
PLAT232_ALERT_2_B Hirshfeld Test Diff (M-X)  Cu1    --  O2      ..      12.94 su   
PLAT232_ALERT_2_B Hirshfeld Test Diff (M-X)  Cu1    --  O5      ..      13.26 su   


请问，用指令
ELMU cu1 O5 cu1 O2
SIMU 0.001 0.001 cu1 O5 cu1 O2
为什么出错，应该在那个文件中输入，并保持为那种文件才不会出错（我用wingx解）
谢谢
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8楼2009-01-07 14:55:15
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maomao11259

木虫 (小有名气)
请问，用指令
ELMU cu1 O5 cu1 O2
SIMU 0.001 0.001 cu1 O5 cu1 O2
为什么出错，应该在那个文件中输入，并保持为那种文件才不会出错（我用wingx解）
谢谢


ins中输入这些口令
你的口令输入有误。
不是固定键长，所以delu后面跟上误差以及原子就可以了。
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9楼2009-01-07 15:15:35
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gzesxx

木虫 (小有名气)
我在INS文件中输入了：
delu   0.001 CU1 O2
delu   0.001 CU1 O5
保存后精修，还是出现如下错误：
Alert level B
PLAT232_ALERT_2_B Hirshfeld Test Diff (M-X)  Cu1    --  O2      ..      12.94 su   
PLAT232_ALERT_2_B Hirshfeld Test Diff (M-X)  Cu1    --  O5      ..      13.26 su   

怎办，谢谢。
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10楼2009-01-07 15:55:31
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