24小时热门版块排行榜    

查看: 1872  |  回复: 18
当前主题已经存档。
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

安静的位置i

金虫 (小有名气)

[交流] 关于用NcoI位点设计引物

我想设计一条引物,以NcoI为酶切位点,它的识别序列是CCATGG。
(1)这样它自身带有ATG,而ATG后面的G恰好会造成移码突变,我是不是需要在G后面再补加两个碱基,这样蛋白就变了,能不能有什么办法去掉那个G,表达天然的目的蛋白呢(除了下面的)?
(2)如果酶切后用klenow补平,是不是就会补成CCATG,这样就没有最后的那个G了?
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xiaoyur

金虫 (著名写手)

楼上开穷疯了,,到文献求助哪了,他们不给会被罚的.


如果是表达载体,载体上有启动子和起始密码子,而且是经过优化的,一般不必改变,
爱的反义词不是恨 而是冷漠!
17楼2009-01-09 23:08:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 19 个回答

eaglezheng

铁虫 (小有名气)

没看明白lz的意思,一般的引物加酶切位点后再加上保护碱基对引物没什么影响
2楼2009-01-05 23:22:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

nnxqwei

至尊木虫 (职业作家)

★ ★ ★ ★ ★
安静的位置i(金币+5,VIP+0):谢谢!
1。基因通常以ATG作为启始密码子,如果NcoI为酶切位点进行连接表达,而基因第4个碱基不是G的话,可以把第4个碱基变为G,这样突变了一个氨基酸,对酶学特性影响不大,总比补加两个碱基从而多一个氨基酸较好。(补加的G是去不掉的)。如果你想表达的蛋白一个氨基酸也不变,那可以考虑用平端连接。也就是ATG........,用高保真酶(如pfu ,pyrobest等)PCR后产生平末端,不用加酶切位点,但平末端连接效果好差,而且有相反的方向。。。。

2。酶切后用klenow补平,也去不掉G的,因为读的方向是5‘-ATGG。。。。3’
3楼2009-01-06 02:12:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

安静的位置i

金虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by nnxqwei at 2009-1-6 02:12:
1。基因通常以ATG作为启始密码子,如果NcoI为酶切位点进行连接表达,而基因第4个碱基不是G的话,可以把第4个碱基变为G,这样突变了一个氨基酸,对酶学特性影响不大,总比补加两个碱基从而多一个氨基酸较好。(补加 ...

谢谢楼上的回答!你的方法很好!突变一个G比较好:)
对于我的第二个问题,我可能没有说清楚,我的质粒上有Nco1这样的位点,我必须要用这个位点插入片段,而且这个位点上目前有一个别的片段,我要先用Nco1酶切掉这个片段,然后用Klenow补平这个质粒,再用你说的高保真酶PCR目的片段,这样平段连接,应该就是ATG+目的基因了吧?呵呵,我觉得您给我提供的方法就是这个意思吧?
4楼2009-01-06 09:14:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考博] 考博求助 10+3 社会实践对别 2026-11-08 3/150 2026-11-13 14:04 by 沐小虫252
[公派出国] 售SCI一区文章,我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +4 G2rhSvqvhNzl 2026-11-10 5/250 2026-11-13 11:37 by Equinoxhua
[公派出国] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 TgvkbZZl9tqB 2026-11-11 4/200 2026-11-12 12:48 by ECLTXnJnRSXf
[考博] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +4 TgvkbZZl9tqB 2026-11-11 6/300 2026-11-12 12:42 by ECLTXnJnRSXf
[考博] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +4 cdqGD6ftHmbl 2026-11-11 5/250 2026-11-12 12:28 by ECLTXnJnRSXf
[硕博家园] 售SCI一区文章,我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +3 TgvkbZZl9tqB 2026-11-11 4/200 2026-11-12 12:28 by ECLTXnJnRSXf
[基金申请] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +4 Z7qfCsdIiD1T 2026-11-11 5/250 2026-11-12 11:44 by HajghKOMynmz
[基金申请] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 Z7qfCsdIiD1T 2026-11-10 7/350 2026-11-12 11:33 by HajghKOMynmz
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 Z7qfCsdIiD1T 2026-11-10 7/350 2026-11-12 11:31 by HajghKOMynmz
[考研] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +5 Z7qfCsdIiD1T 2026-11-10 8/400 2026-11-12 11:22 by HajghKOMynmz
[教师之家] 售SCI一区文章,我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +4 Z7qfCsdIiD1T 2026-11-10 9/450 2026-11-12 11:22 by HajghKOMynmz
[硕博家园] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 Z7qfCsdIiD1T 2026-11-10 8/400 2026-11-12 11:20 by HajghKOMynmz
[教师之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +4 G2rhSvqvhNzl 2026-11-10 6/300 2026-11-12 10:38 by HajghKOMynmz
[教师之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +8 zSbvVX9JFl9J 2026-11-09 12/600 2026-11-12 09:21 by HajghKOMynmz
[基金申请] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +6 zSbvVX9JFl9J 2026-11-09 9/450 2026-11-12 09:21 by HajghKOMynmz
[论文投稿] 售SCI一区文章,我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +3 cdqGD6ftHmbl 2026-11-11 3/150 2026-11-12 07:53 by HajghKOMynmz
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +4 Z7qfCsdIiD1T 2026-11-10 6/300 2026-11-12 07:09 by 9fOTqj074tIg
[考研] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +6 FChKX8meu1ds 2026-11-09 9/450 2026-11-12 05:19 by 9fOTqj074tIg
[教师之家] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +4 FChKX8meu1ds 2026-11-09 7/350 2026-11-12 05:19 by 9fOTqj074tIg
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +5 cqv1zKnzd7hr 2026-11-09 8/400 2026-11-12 05:08 by 9fOTqj074tIg
信息提示
请填处理意见