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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » 关于gromacs中拟合静电势的咨询。
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小范范1989

木虫 (著名写手)

[交流] 关于gromacs中拟合静电势的咨询。

自己自学gromacs，经常看到要计算原子电荷拟合静电势，所以有以下几个问题想咨询，一直搞不明白
1：对于分子，我们能通过高斯计算得到原子电荷是吧？比如pop=MK等，我也看过sob老师的《原子电荷计算方法的对比》文章。
所以，高斯能够计算得到原子电荷了，为什么后面还要进行静电势拟合，得到原子电荷呢？
2：之前在群里咨询，有老师回复“ 原子电荷有多种定义, 高斯也可以得到拟合静电势的电荷. 这种电荷能够最大程度的复现分子周围的静电势, 所以用于MD最合适, 因为MD中计算力时需要知道静电势. 根据静电势拟合电荷有不同的方案, 其中的一种是RESP, 这是我们最常用的.”。我知道高斯能够计算得到原子电荷，有这个原子电荷，不是能够计算静电势？为啥后面又要拟合？
3：也有网友指点“量子力学基于电子云分布几率，经典力学是点电荷，当然要从静电势拟合“、也就是我们高斯计算得到的是静电势？不是原子电荷？然后拟合这个静电势得到原子电荷吗？如果是这样，那为什么高斯计算，采用pop=MK等，能得到原子电荷》？

总之，就是不理解高斯计算了原子电荷，后面为啥要拟合静电势得到原子电荷。拟合静电势是啥过程什么意思？

理解的比较乱，写的也明白。望老师见谅。谢谢指点
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1楼 2017-04-26 08:46:12
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likun_2008

铁杆木虫 (正式写手)
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小范范1989(金币+1): 谢谢参与
小范范1989: 金币+10, 谢谢 2017-04-30 15:57:59
有帖子介绍这个，你搜一下，gromacs+amber+gaussian，哲科文里面，介绍步骤比较详细

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61楼2017-04-30 12:05:58
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假大空

木虫之王 (文学泰斗)
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7楼2017-04-26 09:33:45
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人长在科研

木虫 (著名写手)
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20楼2017-04-26 13:46:21
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foxs2

木虫 (文坛精英)
★
小范范1989(金币+1): 谢谢参与
加油
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21楼2017-04-26 14:45:33
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foxs2

木虫 (文坛精英)
★
小范范1989(金币+1): 谢谢参与
加油
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22楼2017-04-26 14:45:34
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青云丹鹤

至尊木虫 (文坛精英)
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25楼2017-04-26 16:01:39
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liumo111

禁虫 (初入文坛)
★
小范范1989(金币+1): 谢谢参与
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33楼2017-04-27 09:06:15
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青云丹鹤

至尊木虫 (文坛精英)
祝好
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39楼2017-04-27 15:58:30
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kiss20085537

木虫之王 (文学泰斗)
★
小范范1989(金币+1): 谢谢参与
‘’1。
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41楼2017-04-27 18:33:22
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myx690918

新虫 (著名写手)
★
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帮顶
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44楼2017-04-28 13:15:09
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阿蠢蠢蠢

新虫 (正式写手)
★
小范范1989(金币+1): 谢谢参与
哇哦

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47楼2017-04-28 13:32:14
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nono20092楼
2017-04-26 08:57   回复  
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panruijames3楼
2017-04-26 09:15   回复  
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纳米材料7534楼
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happy3729235楼
2017-04-26 09:21   回复  
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yaoyao1456楼
2017-04-26 09:26   回复  
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超级老快8楼
2017-04-26 10:27   回复  
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caoquanrang9楼
2017-04-26 10:54   回复  
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也是小白10楼
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343511楼
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syhorchid12楼
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tan91414楼
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chentao30楼
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youngen31楼
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朝都36楼
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田园STYLE37楼
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ylheping38楼
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风铃响40楼
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zimu010442楼
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slytjiaofei43楼
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woniuaini46楼
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tanliangzhi48楼
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seeker9149楼
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28524653650楼
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