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一株菌株的鉴定
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王雨云
金虫
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性别:
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专业: 生物化学
[交流]
一株菌株的鉴定
请教各位大侠:
我已筛选出一种能水解纤维素酶的菌株,现在要做鉴定菌株。导师要求通过形态学观察鉴定,但我觉得这种方法不可靠。目前还分不清它是真菌还是细菌,如果只是粗略地鉴定,怎样来判定它到底是真菌还是细菌呢?问过其他师兄,他们都是直接送去测序,除了这个方法还有没有自己就能鉴定的方法,包括通过生理生化指标等去鉴定,希望哪位大侠能提供比较具体的鉴定方法,谢谢!
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1楼
2009-01-05 14:52:21
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smallcat227
木虫
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专业: 环境微生物学
有没菌丝啊,就是所谓的毛毛啊,菌落能长多大,给师兄师姐看下真菌细菌肯定能分清楚啊
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3楼
2009-01-05 16:49:16
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ningluztt
铜虫
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专业: 生物
★
lwf991229(金币
+1
,VIP
+0
):感谢参与讨论~~
建议你i到NCBI上检索一下合成纤维素酶的菌种大多是什么菌种,可以根据检索的相关信息设计16srDNA或18srDNA的通用引物进行PCR,将产物拿去测序,在上网比对得到的结果会更可靠
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2楼
2009-01-05 16:15:00
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zhouzhou_3006
木虫
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★
lwf991229(金币
+1
,VIP
+0
):感谢讨论,欢迎常来~
鉴定一般是把可能的范围一步步缩小,就是首先根据菌体形态,大小及菌落特征大概判断是真菌还是细菌,然后生理生化特性的检验,判断大概是什么属;最后用PCR的方法把16S rDNA (细菌)或18S rDNA(真菌)扩增出来,去测序,然后NCBI blast上比对,对于真菌有时还要把ITS序列(保守区)扩增出来测序。引物可以去相关文献上找,也可以直接网上搜索下。
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4楼
2009-01-05 17:01:45
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王雨云
金虫
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性别:
MM
专业: 生物化学
谢谢,非常感谢!
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5楼
2009-01-06 15:06:54
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