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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 一株菌株的鉴定
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王雨云

金虫 (小有名气)

[交流] 一株菌株的鉴定

请教各位大侠：
      我已筛选出一种能水解纤维素酶的菌株，现在要做鉴定菌株。导师要求通过形态学观察鉴定，但我觉得这种方法不可靠。目前还分不清它是真菌还是细菌，如果只是粗略地鉴定，怎样来判定它到底是真菌还是细菌呢？问过其他师兄，他们都是直接送去测序，除了这个方法还有没有自己就能鉴定的方法，包括通过生理生化指标等去鉴定，希望哪位大侠能提供比较具体的鉴定方法，谢谢！
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1楼 2009-01-05 14:52:21
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ningluztt

铜虫 (小有名气)
★
lwf991229(金币+1,VIP+0):感谢参与讨论~~
建议你i到NCBI上检索一下合成纤维素酶的菌种大多是什么菌种，可以根据检索的相关信息设计16srDNA或18srDNA的通用引物进行PCR,将产物拿去测序，在上网比对得到的结果会更可靠
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2楼2009-01-05 16:15:00
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smallcat227

木虫 (著名写手)
有没菌丝啊，就是所谓的毛毛啊，菌落能长多大，给师兄师姐看下真菌细菌肯定能分清楚啊
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3楼2009-01-05 16:49:16
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zhouzhou_3006

木虫 (著名写手)
★
lwf991229(金币+1,VIP+0):感谢讨论,欢迎常来~
鉴定一般是把可能的范围一步步缩小，就是首先根据菌体形态，大小及菌落特征大概判断是真菌还是细菌，然后生理生化特性的检验，判断大概是什么属；最后用PCR的方法把16S rDNA (细菌）或18S rDNA（真菌）扩增出来，去测序，然后NCBI blast上比对，对于真菌有时还要把ITS序列（保守区）扩增出来测序。引物可以去相关文献上找，也可以直接网上搜索下。
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为梦想努力。
4楼2009-01-05 17:01:45
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王雨云

金虫 (小有名气)
谢谢，非常感谢！
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5楼2009-01-06 15:06:54
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王雨云

金虫 (小有名气)
太感谢了！
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6楼2009-01-06 15:09:49
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王雨云

金虫 (小有名气)
昨天拿了一些去微生物实验室去看了一下，他们说是细菌。纤维素酶细菌和真菌都能产，但我最需要真菌，因为真菌产的酶一般活性高些，而且我们实验室以前已经做过一株细菌的，导师希望我能做真菌的。16S rDNA 扩增测序已经做过了，也说是细菌。目前还在鉴定剩下的菌株，看能不能找到是真菌的。
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7楼2009-01-06 15:24:05
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smallcat227

木虫 (著名写手)
★
lwf991229(金币+1,VIP+0):感谢讨论,欢迎常来~
是啊，真菌的纤维素酶比细菌高多了
真菌细菌一眼就能看出啊，进一步才要分子鉴定啊

其实个人的感觉，我们靠传统方法分到的菌，细菌产芽胞的就芽胞杆菌属，然后往下再分，不产芽胞的，如果是杆菌，大多就假单胞菌属……
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8楼2009-01-07 20:40:27
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