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王雨云

金虫 (小有名气)

[交流] 一株菌株的鉴定

请教各位大侠:
      我已筛选出一种能水解纤维素酶的菌株,现在要做鉴定菌株。导师要求通过形态学观察鉴定,但我觉得这种方法不可靠。目前还分不清它是真菌还是细菌,如果只是粗略地鉴定,怎样来判定它到底是真菌还是细菌呢?问过其他师兄,他们都是直接送去测序,除了这个方法还有没有自己就能鉴定的方法,包括通过生理生化指标等去鉴定,希望哪位大侠能提供比较具体的鉴定方法,谢谢!
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ningluztt

铜虫 (小有名气)


lwf991229(金币+1,VIP+0):感谢参与讨论~~
建议你i到NCBI上检索一下合成纤维素酶的菌种大多是什么菌种,可以根据检索的相关信息设计16srDNA或18srDNA的通用引物进行PCR,将产物拿去测序,在上网比对得到的结果会更可靠
2楼2009-01-05 16:15:00
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smallcat227

木虫 (著名写手)

有没菌丝啊,就是所谓的毛毛啊,菌落能长多大,给师兄师姐看下真菌细菌肯定能分清楚啊
3楼2009-01-05 16:49:16
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zhouzhou_3006

木虫 (著名写手)


lwf991229(金币+1,VIP+0):感谢讨论,欢迎常来~
鉴定一般是把可能的范围一步步缩小,就是首先根据菌体形态,大小及菌落特征大概判断是真菌还是细菌,然后生理生化特性的检验,判断大概是什么属;最后用PCR的方法把16S rDNA (细菌)或18S rDNA(真菌)扩增出来,去测序,然后NCBI blast上比对,对于真菌有时还要把ITS序列(保守区)扩增出来测序。引物可以去相关文献上找,也可以直接网上搜索下。
为梦想努力。
4楼2009-01-05 17:01:45
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王雨云

金虫 (小有名气)

谢谢,非常感谢!
5楼2009-01-06 15:06:54
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王雨云

金虫 (小有名气)

太感谢了!
6楼2009-01-06 15:09:49
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王雨云

金虫 (小有名气)

昨天拿了一些去微生物实验室去看了一下,他们说是细菌。纤维素酶细菌和真菌都能产,但我最需要真菌,因为真菌产的酶一般活性高些,而且我们实验室以前已经做过一株细菌的,导师希望我能做真菌的。16S rDNA 扩增测序已经做过了,也说是细菌。目前还在鉴定剩下的菌株,看能不能找到是真菌的。
7楼2009-01-06 15:24:05
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smallcat227

木虫 (著名写手)


lwf991229(金币+1,VIP+0):感谢讨论,欢迎常来~
是啊,真菌的纤维素酶比细菌高多了
真菌细菌一眼就能看出啊,进一步才要分子鉴定啊

其实个人的感觉,我们靠传统方法分到的菌,细菌产芽胞的就芽胞杆菌属,然后往下再分,不产芽胞的,如果是杆菌,大多就假单胞菌属……
8楼2009-01-07 20:40:27
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