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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » PCR相关 » mega中数值如何看？
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LX55

新虫 (初入文坛)

[求助] mega中数值如何看？ 已有1人参与

请问谁能教教我怎么看mega建树中的数值，怎样控制在百分之五十以上？

mega中数值如何看？


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1楼 2017-04-22 21:41:05
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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
西门吹雪170: 金币+2, 鼓励回帖交流 2017-04-23 22:48:23
这个数值是检测建树结果一致性的百分比，这个值与你选择参与建树的序列关系很大， 如果选的序列间相似性太高，很难得到一致性高的树。
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2楼2017-04-23 18:42:38
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LX55

新虫 (初入文坛)
也就是不相似的选多点是吗？

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3楼2017-04-24 08:06:32
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laokuang1988

铜虫 (小有名气)
我前几天构树时一开始选了很多，然后再慢慢减，保证在50以上。

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4楼2017-04-24 09:53:36
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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by LX55 at 2017-04-24 08:06:32
也就是不相似的选多点是吗？

也不是不相似的选多点，各个相似度的均匀选，另外还要看你想用进化树说明什么问题。
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5楼2017-04-24 11:38:17
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我欲乘风归去

木虫 (正式写手)
数值这么低，是不是你选的基因序列相似度不高，可以参考别人文章里的基因序列下载下来进行比对。
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。
6楼2017-04-24 14:12:10
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闷葫芦同学

新虫 (初入文坛)
这个分支点表示一种亲缘关系，数值表示亲缘关系的可信度

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7楼2017-04-24 14:43:15
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LX55

新虫 (初入文坛)
感谢各位指点，受益良多

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8楼2017-04-24 23:37:28
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LX55

新虫 (初入文坛)
请问我只测出单向序列，因为时间问题没有再测互补序列，我需要去比对，但是为什么在Blast里面比对显示没有结果呢？是因为不是全序列吗？

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9楼2017-05-02 00:39:05
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