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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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LX55

新虫 (初入文坛)

[求助] mega中数值如何看? 已有1人参与

请问谁能教教我怎么看mega建树中的数值,怎样控制在百分之五十以上?

mega中数值如何看?


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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
西门吹雪170: 金币+2, 鼓励回帖交流 2017-04-23 22:48:23
这个数值是检测建树结果一致性的百分比,这个值与你选择参与建树的序列关系很大, 如果选的序列间相似性太高,很难得到一致性高的树。
2楼2017-04-23 18:42:38
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LX55

新虫 (初入文坛)

也就是不相似的选多点是吗?

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3楼2017-04-24 08:06:32
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laokuang1988

铜虫 (小有名气)

我前几天构树时一开始选了很多,然后再慢慢减,保证在50以上。

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4楼2017-04-24 09:53:36
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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by LX55 at 2017-04-24 08:06:32
也就是不相似的选多点是吗?

也不是不相似的选多点,各个相似度的均匀选,另外还要看你想用进化树说明什么问题。
5楼2017-04-24 11:38:17
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我欲乘风归去

木虫 (正式写手)

数值这么低,是不是你选的基因序列相似度不高,可以参考别人文章里的基因序列下载下来进行比对。
6楼2017-04-24 14:12:10
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闷葫芦同学

新虫 (初入文坛)

这个分支点表示一种亲缘关系,数值表示亲缘关系的可信度

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7楼2017-04-24 14:43:15
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LX55

新虫 (初入文坛)

感谢各位指点,受益良多

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8楼2017-04-24 23:37:28
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LX55

新虫 (初入文坛)

请问我只测出单向序列,因为时间问题没有再测互补序列,我需要去比对,但是为什么在Blast里面比对显示没有结果呢?是因为不是全序列吗?

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9楼2017-05-02 00:39:05
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