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叫我黄小妞儿

新虫 (小有名气)

[求助] Gel red染色原理已有3人参与

设计了一条20个bp的DNA单链,全部由A C两种碱基组成,公司送来样品后,就跑电泳,然后各种跑不出来,上样量很大也看不出条带,测浓度后发现浓度很大,用别的样品也是20个bp的跑的就很亮的条带,一直找不到原因,换了个公司也是一样。后来问公司技术人员,他们说我的链里边只有A,C两种碱基,所以染不上色,我是用gel red染的,gelred的染色原理不是嵌入到碱基内部吗?为什么染不上呢?换stain all行吗?求大神指点迷津!

@biostar2009 @飞约疯人院 发自小木虫Android客户端
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ghst110

银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

Gelred和EB,以及SYBR Green都是既可以染双链也可以染单链的DNA的,对于单链RNA或DNA来说,分子内部也会形成局部双链。LZ的只含有AC,且20bp,这个是染色不成功的原因吧。
*才随遇长,识以穷精*
10楼2018-07-10 17:31:42
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jurkat.1640

至尊木虫 (文坛精英)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
换个染料呗,没有双链结构没法插入。
3楼2017-04-17 16:06:32
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痞子无敌

金虫 (正式写手)

好像是需要双链才可以显色…

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当你当你的眼睛眯着笑
5楼2017-04-17 17:01:32
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匿名

本帖仅楼主可见

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6楼2017-04-17 17:30:40
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叫我黄小妞儿

新虫 (小有名气)

2楼2017-04-17 11:03:17
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叫我黄小妞儿

新虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by jurkat.1640 at 2017-04-17 16:06:32
换个染料呗,没有双链结构没法插入。

EB和gelred都不行,请问什么染色剂可以染这种单链呢?

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4楼2017-04-17 16:51:54
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叫我黄小妞儿

新虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by 痞子无敌 at 2017-04-17 17:01:32
好像是需要双链才可以显色…

但是别的也是20bp的单链就可以染哎,但是是4种碱基都有的

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7楼2017-04-17 20:43:18
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叫我黄小妞儿

新虫 (小有名气)

送红花一朵
引用回帖:
6楼: Originally posted by 格日木朗 at 2017-04-17 17:30:40
这类染料和EB一样,是插入到DNA双链的碱基对中进行染色的,没有双链结构,就自然无法插入染色。如果有可能的话看能不能试一下TaqMan探针进行染色,你搜一下原理,把这个探针的粹灭基团弄掉,保留荧光基团和一段DNA特 ...

好的,我查查。谢谢

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8楼2017-04-17 20:43:40
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柴雯鑫

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

我也出现了一样的问题 想问问您 最后是怎样解决的呢
9楼2018-07-10 16:17:55
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