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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 分子生理 » Gel red染色原理
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叫我黄小妞儿

新虫 (小有名气)

[求助] Gel red染色原理 已有3人参与

设计了一条20个bp的DNA单链，全部由A C两种碱基组成，公司送来样品后，就跑电泳，然后各种跑不出来，上样量很大也看不出条带，测浓度后发现浓度很大，用别的样品也是20个bp的跑的就很亮的条带，一直找不到原因，换了个公司也是一样。后来问公司技术人员，他们说我的链里边只有A,C两种碱基，所以染不上色，我是用gel red染的，gelred的染色原理不是嵌入到碱基内部吗？为什么染不上呢？换stain all行吗？求大神指点迷津！

@biostar2009 @飞约疯人院 发自小木虫Android客户端
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1楼 2017-04-17 10:45:30
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ghst110

银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

Gelred和EB，以及SYBR Green都是既可以染双链也可以染单链的DNA的，对于单链RNA或DNA来说，分子内部也会形成局部双链。LZ的只含有AC,且20bp，这个是染色不成功的原因吧。
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*才随遇长，识以穷精*
10楼2018-07-10 17:31:42
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jurkat.1640

至尊木虫 (文坛精英)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
换个染料呗，没有双链结构没法插入。
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3楼2017-04-17 16:06:32
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痞子无敌

金虫 (正式写手)
好像是需要双链才可以显色…

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当你当你的眼睛眯着笑
5楼2017-04-17 17:01:32
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匿名

本帖仅楼主可见
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叫我黄小妞儿
6楼2017-04-17 17:30:40
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普通回帖

叫我黄小妞儿

新虫 (小有名气)
有人吗

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2楼2017-04-17 11:03:17
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叫我黄小妞儿

新虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by jurkat.1640 at 2017-04-17 16:06:32
换个染料呗，没有双链结构没法插入。

EB和gelred都不行，请问什么染色剂可以染这种单链呢？

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4楼2017-04-17 16:51:54
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叫我黄小妞儿

新虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by 痞子无敌 at 2017-04-17 17:01:32
好像是需要双链才可以显色…

但是别的也是20bp的单链就可以染哎，但是是4种碱基都有的

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7楼2017-04-17 20:43:18
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叫我黄小妞儿

新虫 (小有名气)
送红花一朵
引用回帖:
6楼: Originally posted by 格日木朗 at 2017-04-17 17:30:40
这类染料和EB一样，是插入到DNA双链的碱基对中进行染色的，没有双链结构，就自然无法插入染色。如果有可能的话看能不能试一下TaqMan探针进行染色，你搜一下原理，把这个探针的粹灭基团弄掉，保留荧光基团和一段DNA特 ...

好的，我查查。谢谢

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8楼2017-04-17 20:43:40
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柴雯鑫

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

我也出现了一样的问题 想问问您 最后是怎样解决的呢
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9楼2018-07-10 16:17:55
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