| 查看: 2099 | 回复: 26 | |||
[交流]
优化过渡态最后结构变成了反应物/产物
|
|||
|
做的是胞嘧啶有一个水分子的质子转移。 不知道是不是过渡态的猜测有问题？ 改了几次结构都遇到了同样的问题，求解决方案。 |
回复此楼» 本帖附件资源列表
-
欢迎监督和反馈：小木虫仅提供交流平台，不对该内容负责。
本内容由用户自主发布，如果其内容涉及到知识产权问题，其责任在于用户本人，如对版权有异议，请联系邮箱：xiaomuchong@tal.com - 附件 1 : (2)ts.out
2017-04-14 07:51:37, 1.7 M
» 猜你喜欢
求助火焰封管的时候管子炸了
已经有1人回复
-
已知面上挂了，小学校实验方向无平台，感觉太难了
已经有26人回复
-
物理化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有81人回复
-
求助各位大佬，球球了，在这科萨头
已经有0人回复
-
请问四氢呋喃溶解的聚合物用甲醇沉淀时，如何使沉淀过程加速？
已经有2人回复
-
七嗪类物质合成求助
已经有0人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
ADF搜索过渡态典型案例
已经有13人回复- Multiwfn 2013年暑期培训班感想与杂谈
已经有44人回复
- 通过键级曲线和ELF/LOL/RDG等值面动画研究化学反应过程
已经有12人回复
- 跑IRC，我设置forward跑60个点，为啥只跑了50个点就停了？
已经有2人回复
- 杂谈量子化学中的简化招数，和SCC-DFTB模型
已经有24人回复
- 使用Multiwfn做拓扑分析以及计算孤对电子角度
已经有18人回复
» 抢金币啦！回帖就可以得到:
-
中国地质大学（武汉）杨明教授组招收2026年博士
+2/478
-
加拿大/英属哥伦比亚大学曹彦凯课题组招收全奖博士/博后 [机器学习/优化/控制方向]
+1/82
-
加拿大/英属哥伦比亚大学曹彦凯课题组招收全奖博士/博后 [机器学习/优化/控制方向]
+1/82
-
湘潭大学化学学院陈华杰教授课题组招收有机/高分子方向的博士研究生
+1/81
-
湘潭大学化学学院理论与计算化学课题组裴勇教授招生博士生2名
+2/70
-
2026申博自荐
+1/63
-
Call for papers，征稿
+1/57
-
国家青年人才叶立群教授课题组招收2026级博士研究生
+1/32
-
青岛大学 丁欣 课题组 招收2026秋化学博士1名
+1/31
-
中国矿业大学博士招生
+1/30
-
博士/硕士招生
+1/17
-
伦敦大学学院（University College London）机械工程系博士招生/CSC联培招生
+1/7
-
海南大学国家高层次人才团队2026年博士招生
+1/7
-
欢迎报考中山大学课题组，确保2025-2026级硕士研究生名额
+1/5
-
东华大学材料科学与工程学院朱美芳院士团队曹冉副研究员招聘博士研究生
+1/3
-
澳洲皇家墨尔本理工RMIT招收网安方向CSC PhD
+1/2
-
东莞理工学院-大连化物所联合招聘光催化方向博士后2名（年薪48W）
+1/2
-
澳大利亚南昆士兰大学（UniSQ）量子点课题组 招收CSC全奖博士生
+1/2
-
招收理论凝聚态物理/纳米光学方向博士后(硕士、博士研究生)
+1/2
-
兰州大学物理学院韩卫华教授课题组招收 2026年博士研究生 (物理、电子以及核能源方向)
+1/1
|
输入文件~ %chk=(2)ts.chk # opt(ts,modred,maxstep=10,noeigen) freq b3lyp/6-31g(d) geom=connectivity Title Card Required 0 1 N 2.22669453 0.03792186 2.39529382 C 2.81457753 1.25264886 2.39529382 C 2.07134553 2.44892486 2.39529282 C 0.66838253 2.32599586 2.39526982 N 0.04909453 1.12698186 2.39532682 H 2.56122353 3.42839086 2.39529782 H 0.01315453 3.21532686 2.39527382 N 4.28452635 1.26491574 2.39526322 H 4.61391757 1.74069164 3.21082359 C 0.86558953 0.03792186 2.39529382 O 0.31665344 -1.05979222 2.39530095 H -0.94743943 1.04379496 2.39538940 H 3.03527727 -1.18585824 2.39529462 H 1.21906323 -1.99555745 2.39530703 O 2.31507774 -2.74744256 2.26623542 H 3.27507774 -2.74744256 2.26623542 1 2 1.0 10 1.0 2 3 1.0 8 2.0 3 4 2.0 6 1.0 4 5 1.0 7 1.0 5 10 1.0 12 1.0 6 7 8 9 1.0 9 10 11 2.0 11 12 13 14 15 16 1.0 16 |
2楼2017-04-14 07:55:01
★
wittymadder(金币+1): 谢谢参与
wittymadder(金币+1): 谢谢参与
|
结构弄成这样呢  N 2.22669453 0.03792186 2.39529382 C 2.81457753 1.25264886 2.39529382 C 2.07134553 2.44892486 2.39529282 C 0.66838253 2.32599586 2.39526982 N 0.04909453 1.12698186 2.39532682 H 2.56122353 3.42839086 2.39529782 H 0.01315453 3.21532686 2.39527382 N 4.28452635 1.26491574 2.39526322 H 4.61391757 1.74069164 3.21082359 C 0.86558953 0.03792186 2.39529382 O 0.31665344 -1.05979222 2.39530095 H -0.94743943 1.04379496 2.39538940 H 2.87570060 -1.04796506 2.39362767 H 0.91226613 -2.26366296 2.42272601 O 2.31173981 -2.51401207 2.39342120 H 2.61006309 -3.41164171 2.22951806 |
3楼2017-04-14 12:05:31
★ ★ ★
wittymadder: 金币+3 2017-04-18 09:45:23
wittymadder: 金币+3 2017-04-18 09:45:23
|
我就是好奇，平时gaussain真的玩儿得不多，玩儿过它自带的部分例子，从未真正用它做些什么。最近帮朋友的忙才算认真学习想玩儿一下，所以就玩儿了一下这个例子，还真玩儿出来了 高手们一定不觉得怎么着，我只能算个老初学者 1.用TS的话，初猜结构very重要，当然，这谁都知道 ，但问题是是否真的足够重视了。本例中楼主给的结构个人觉得不是很合理的地方：（1）环上=N-H; (2)OH上H的空间取向 所以我就调了一下它们的位置，输入文件如下（maxstep取为默认值的一半，这个应该关系不大）： %chk=ts.chk %nproc=16 # freq rb3lyp/6-31g(d) opt(ts,modred,maxstep=15,noeigen) geom=connectivity Title Card Required 0 1 N -0.33343534 0.48135271 -0.03979690 C 0.90189066 1.21505871 -0.01588090 C 2.06782366 0.31881571 -0.00782890 C 1.91642666 -1.02010029 0.00811610 N 0.66655466 -1.60763829 0.01393110 H 3.05016866 0.77229471 -0.00331090 H 2.75218266 -1.71170629 0.01755010 N 0.91264966 2.45722671 0.06176910 H 1.71684762 3.03569452 0.08365676 C -0.51197134 -0.87551429 -0.01094190 O -1.61042034 -1.43821929 -0.00845590 H 0.55232266 -2.61101629 0.02353310 H -1.38189797 0.98486745 -0.01043957 H -2.67277046 -0.61283821 -0.12096498 O -2.53561361 0.72911506 -0.06758503 H -2.86649061 0.84342006 0.83627197 1 2 1.0 10 1.5 13 1.0 2 3 1.0 8 2.0 3 4 2.0 6 1.0 4 5 1.5 7 1.0 5 10 1.0 12 1.0 6 7 8 9 1.0 9 10 11 2.0 11 12 13 14 15 16 1.0 16 2.跑了不足8分钟，得到了过渡态。过渡态结构如下： Standard orientation: --------------------------------------------------------------------- Center Atomic Atomic Coordinates (Angstroms) Number Number Type X Y Z --------------------------------------------------------------------- 1 7 0 -0.304823 0.511241 -0.007128 2 6 0 0.995036 1.041348 -0.002537 3 6 0 2.074330 0.042354 -0.006661 4 6 0 1.786585 -1.272610 0.002910 5 7 0 0.470213 -1.703291 0.015786 6 1 0 3.106010 0.375489 -0.014822 7 1 0 2.537027 -2.055013 0.002676 8 7 0 1.121841 2.321164 0.009048 9 1 0 2.115151 2.566112 0.009092 10 6 0 -0.555619 -0.789814 0.002737 11 8 0 -1.759566 -1.249982 0.001205 12 1 0 0.222313 -2.682030 0.009646 13 1 0 -1.560851 1.102268 -0.063961 14 1 0 -2.461565 -0.237008 -0.036166 15 8 0 -2.704717 0.955798 -0.097218 16 1 0 -3.056432 1.252182 0.759002 --------------------------------------------------------------------- ****** 1 imaginary frequencies (negative Signs) ****** Diagonal vibrational polarizability: 103.1522179 37.6589729 60.3559150 Harmonic frequencies (cm**-1), IR intensities (KM/Mole), Raman scattering activities (A**4/AMU), depolarization ratios for plane and unpolarized incident light, reduced masses (AMU), force constants (mDyne/A), and normal coordinates: 1 2 3 A A A Frequencies -- -1473.2173 92.4296 149.5708 Red. masses -- 1.0677 5.4629 5.7827 Frc consts -- 1.3654 0.0275 0.0762 IR Inten -- 186.5913 13.4439 2.5885 Atom AN X Y Z X Y Z X Y Z 1 7 -0.02 0.02 0.00 0.00 0.00 -0.13 0.00 0.00 0.38 2 6 0.00 0.01 0.00 0.00 0.00 -0.05 0.00 0.00 0.10 3 6 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.25 0.00 0.00 0.20 4 6 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.21 0.00 0.00 -0.07 5 7 0.01 0.01 0.00 0.00 0.00 -0.10 0.00 0.00 -0.28 6 1 -0.01 0.01 0.00 0.00 0.00 0.48 0.00 0.00 0.34 7 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.39 0.00 0.00 -0.14 8 7 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.23 0.00 0.00 -0.26 9 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.12 0.00 0.00 -0.41 10 6 -0.04 -0.03 0.00 0.00 0.00 -0.15 0.00 0.00 0.08 11 8 0.03 -0.01 0.00 0.00 0.00 -0.19 0.00 0.00 0.07 12 1 -0.01 0.01 0.00 0.00 0.00 -0.03 0.00 0.00 -0.45 13 1 0.67 -0.15 0.03 -0.01 0.01 0.09 0.01 0.00 0.17 14 1 -0.33 0.64 -0.01 0.00 0.00 0.04 0.00 0.00 -0.02 15 8 0.00 -0.02 0.00 -0.02 0.01 0.31 0.02 0.00 -0.12 16 1 -0.01 -0.04 0.00 0.17 -0.15 0.44 -0.21 0.03 -0.22 4 5 6 A A A Frequencies -- 192.8165 262.2318 389.7402 Red. masses -- 6.6349 5.8589 2.9517 Frc consts -- 0.1453 0.2374 0.2642 IR Inten -- 4.4574 21.5772 17.4612 Atom AN X Y Z X Y Z X Y Z 1 7 0.00 0.00 0.31 -0.05 0.17 -0.01 0.00 0.00 -0.13 2 6 0.00 0.00 0.03 0.07 0.04 0.00 0.00 0.00 0.12 3 6 0.00 0.00 -0.18 0.00 -0.04 0.00 0.00 0.00 0.21 4 6 0.00 0.00 -0.01 -0.03 -0.02 0.00 0.00 0.00 -0.23 5 7 0.00 0.00 0.32 -0.05 0.10 -0.01 0.00 0.00 0.18 6 1 0.00 0.00 -0.45 0.01 -0.06 0.01 0.00 0.00 0.08 7 1 0.00 0.00 -0.11 -0.08 -0.07 0.01 -0.01 -0.01 -0.67 8 7 0.01 0.00 -0.11 0.37 0.00 0.01 0.00 0.00 -0.08 9 1 0.01 0.00 -0.35 0.43 -0.26 0.01 0.00 0.00 0.09 10 6 0.00 0.00 0.07 -0.02 0.13 0.00 0.00 0.00 0.03 11 8 0.00 -0.01 -0.40 0.05 -0.01 0.01 0.00 0.00 0.01 12 1 0.00 0.01 -0.13 -0.16 0.13 0.00 -0.01 0.00 -0.58 13 1 0.00 0.01 0.23 -0.22 -0.04 0.01 0.00 -0.01 -0.13 14 1 0.00 0.00 -0.28 -0.16 -0.07 -0.02 0.00 0.00 0.01 15 8 0.00 0.02 0.07 -0.27 -0.27 0.00 -0.01 0.00 0.00 16 1 -0.09 -0.27 0.13 -0.35 -0.36 0.00 0.13 0.02 0.05 7 8 9 A A A Frequencies -- 456.0347 500.9191 502.3607 Red. masses -- 6.5092 1.4374 2.6645 Frc consts -- 0.7976 0.2125 0.3962 IR Inten -- 20.8683 64.8249 23.2918 Atom AN X Y Z X Y Z X Y Z 1 7 -0.06 -0.06 0.01 0.03 0.02 0.00 -0.09 -0.05 0.00 2 6 -0.03 -0.15 0.00 0.04 0.01 -0.08 -0.10 -0.01 -0.06 3 6 0.13 -0.01 0.00 0.03 -0.05 -0.05 -0.08 0.11 -0.03 4 6 0.25 -0.02 0.00 -0.01 -0.05 0.06 0.02 0.12 0.04 5 7 0.20 -0.02 0.00 -0.02 -0.01 0.03 0.04 0.01 0.03 6 1 0.07 0.18 0.00 0.04 -0.09 0.14 -0.12 0.23 0.11 7 1 0.26 -0.01 0.00 -0.03 -0.07 0.25 0.08 0.18 0.18 8 7 -0.03 -0.16 0.00 -0.07 0.02 0.04 0.18 -0.04 0.03 9 1 -0.04 -0.15 0.00 -0.10 0.14 0.00 0.25 -0.35 0.00 10 6 0.05 -0.07 0.00 0.02 0.03 -0.01 -0.05 -0.08 -0.01 11 8 0.00 0.12 0.01 0.03 0.05 0.03 -0.06 -0.11 0.02 12 1 0.28 -0.04 -0.02 -0.07 0.01 -0.90 0.16 -0.02 -0.68 13 1 -0.29 0.11 -0.02 0.00 0.01 0.07 0.01 -0.01 0.01 14 1 -0.20 0.38 -0.07 0.00 0.03 -0.02 0.02 -0.07 0.05 15 8 -0.39 0.24 -0.02 -0.02 -0.03 0.00 0.07 0.07 0.00 16 1 -0.29 0.05 0.10 -0.13 -0.08 -0.03 0.06 0.18 -0.04 10 11 12 A A A Frequencies -- 556.2485 567.0855 596.6783 Red. masses -- 1.4927 2.7445 3.1383 Frc consts -- 0.2721 0.5200 0.6583 IR Inten -- 78.7314 38.6474 28.1184 Atom AN X Y Z X Y Z X Y Z 1 7 0.01 -0.01 0.02 -0.02 0.01 0.02 0.13 -0.11 0.03 2 6 -0.02 0.06 -0.01 0.06 -0.11 -0.01 0.15 0.08 0.01 3 6 -0.08 0.00 -0.01 0.17 0.02 -0.01 0.13 0.06 -0.02 4 6 -0.03 -0.02 0.01 0.03 0.06 0.00 -0.05 0.08 0.01 5 7 0.00 -0.09 -0.02 -0.03 0.19 -0.02 -0.02 -0.07 0.00 6 1 -0.07 -0.03 0.02 0.16 0.05 0.03 0.19 -0.10 -0.02 7 1 0.03 0.04 0.03 -0.10 -0.07 0.03 -0.04 0.08 0.04 8 7 0.03 0.07 0.01 -0.06 -0.12 0.01 0.04 0.11 0.00 9 1 0.05 0.02 -0.02 -0.09 -0.01 -0.02 0.02 0.22 -0.05 10 6 0.04 -0.03 0.03 -0.11 0.06 0.03 -0.08 -0.10 0.00 11 8 0.04 0.01 0.03 -0.10 -0.05 0.02 -0.16 0.01 -0.03 12 1 -0.01 -0.08 -0.04 0.01 0.19 -0.07 0.15 -0.12 -0.08 13 1 -0.03 -0.03 -0.23 0.02 0.00 -0.22 -0.03 -0.15 -0.31 14 1 0.04 0.04 -0.27 -0.02 -0.05 -0.23 -0.18 0.03 0.30 15 8 -0.05 0.05 -0.04 0.04 -0.03 -0.03 -0.11 -0.06 0.00 16 1 0.59 -0.52 0.43 0.57 -0.47 0.35 0.34 0.57 -0.02 13 14 15 A A A Frequencies -- 605.1961 684.9416 701.1973 Red. masses -- 1.4099 7.6706 2.8228 Frc consts -- 0.3042 2.1203 0.8177 IR Inten -- 39.6813 13.2352 7.3048 Atom AN X Y Z X Y Z X Y Z 1 7 -0.05 0.06 0.04 0.05 -0.09 0.00 0.00 0.00 -0.03 2 6 -0.05 -0.03 0.01 -0.13 -0.10 0.02 0.00 0.00 0.28 3 6 -0.05 -0.04 -0.02 -0.12 0.12 0.00 0.00 0.00 -0.09 4 6 0.02 -0.05 0.02 0.04 0.11 0.01 0.00 0.00 0.17 5 7 0.01 0.03 -0.01 0.03 -0.09 0.00 0.00 0.00 -0.03 6 1 -0.07 0.02 -0.01 -0.18 0.30 -0.05 0.00 -0.01 -0.83 7 1 0.02 -0.05 0.04 0.17 0.24 -0.01 -0.01 -0.01 -0.20 8 7 -0.02 -0.04 0.00 0.02 -0.15 -0.01 0.00 0.00 -0.09 9 1 -0.02 -0.06 -0.05 0.07 -0.37 -0.01 0.00 0.01 0.07 10 6 0.04 0.05 0.00 0.04 -0.02 -0.01 0.00 0.00 -0.17 11 8 0.08 0.00 -0.03 -0.11 0.51 0.00 0.00 -0.01 0.07 12 1 -0.08 0.05 -0.08 0.18 -0.12 0.00 0.00 0.01 -0.32 13 1 0.01 -0.05 -0.40 0.07 -0.17 -0.04 0.00 0.01 0.02 14 1 -0.01 -0.01 0.32 0.08 0.05 0.00 0.00 0.00 -0.01 15 8 -0.02 -0.03 0.00 0.11 -0.27 0.01 0.00 0.01 -0.01 16 1 0.56 0.60 0.02 0.15 -0.26 0.01 -0.01 -0.08 0.02 16 17 18 A A A Frequencies -- 747.6111 781.3101 801.3038 Red. masses -- 8.8573 1.6766 8.6249 Frc consts -- 2.9168 0.6030 3.2629 IR Inten -- 12.9779 4.8034 16.0794 Atom AN X Y Z X Y Z X Y Z 1 7 -0.01 0.01 0.29 0.00 0.00 -0.03 -0.20 0.11 -0.01 2 6 0.00 0.00 -0.23 0.00 0.00 0.18 -0.11 0.18 0.01 3 6 0.01 0.00 0.14 0.00 0.00 -0.11 0.04 -0.17 -0.01 4 6 0.00 0.00 -0.12 0.00 0.00 -0.08 0.42 -0.32 -0.01 5 7 0.00 0.01 0.21 0.00 0.00 0.04 0.15 -0.02 0.00 6 1 0.01 -0.01 0.04 0.00 0.00 0.70 -0.03 0.07 0.04 7 1 -0.01 -0.01 -0.05 0.00 0.01 0.45 0.38 -0.38 0.03 8 7 0.00 0.00 0.03 0.00 0.00 -0.01 0.04 0.26 0.00 9 1 0.00 0.00 0.36 0.00 0.00 -0.49 0.06 0.17 -0.02 10 6 0.00 0.00 -0.67 0.00 0.00 -0.08 -0.13 -0.02 0.00 11 8 0.00 0.00 0.16 0.00 0.00 0.02 -0.31 0.04 0.00 12 1 0.00 0.00 0.35 0.00 0.00 0.09 0.06 -0.01 0.00 13 1 0.00 -0.02 0.01 0.00 0.01 0.01 -0.02 0.00 -0.01 14 1 0.00 0.00 0.07 0.00 0.00 0.00 -0.03 -0.12 -0.05 15 8 -0.01 0.00 -0.02 0.00 0.00 0.00 0.12 -0.07 0.00 16 1 0.22 -0.03 0.09 -0.02 -0.03 0.00 0.12 -0.11 0.01 19 20 21 A A A Frequencies -- 855.8833 946.5597 1011.3857 Red. masses -- 1.2058 1.2454 7.1344 Frc consts -- 0.5204 0.6575 4.2997 IR Inten -- 99.8848 0.0575 12.5245 Atom AN X Y Z X Y Z X Y Z 1 7 0.00 0.00 -0.02 0.00 0.00 -0.01 0.33 -0.25 0.00 2 6 0.00 0.00 -0.04 0.00 0.00 0.01 0.01 0.01 0.00 3 6 0.00 0.00 0.07 0.00 0.00 0.09 -0.36 -0.09 0.00 4 6 0.00 0.00 0.03 0.00 0.00 -0.12 0.07 -0.12 0.00 5 7 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.08 0.39 0.00 6 1 0.00 0.00 -0.23 0.00 0.00 -0.58 -0.43 0.07 0.00 7 1 0.00 0.00 -0.25 0.01 0.00 0.80 -0.06 -0.23 0.00 8 7 0.00 0.00 0.09 0.00 0.00 0.00 0.00 0.05 0.00 9 1 0.00 0.01 -0.93 0.00 0.00 -0.05 0.02 0.01 0.00 10 6 0.00 0.00 -0.03 0.00 0.00 0.02 0.02 -0.01 0.00 11 8 0.00 0.00 0.01 0.00 0.00 0.00 -0.07 -0.02 0.00 12 1 0.00 0.00 -0.02 0.00 0.00 -0.03 0.00 0.42 -0.02 13 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.11 -0.22 0.10 14 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.09 -0.05 -0.02 15 8 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.07 0.02 0.00 16 1 -0.02 -0.01 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.04 0.02 0.01 22 23 24 A A A Frequencies -- 1028.3781 1107.2104 1171.2847 Red. masses -- 3.2826 1.9198 1.4604 Frc consts -- 2.0454 1.3867 1.1805 IR Inten -- 109.2684 5.9230 1523.4136 Atom AN X Y Z X Y Z X Y Z 1 7 0.08 0.17 0.00 0.10 -0.01 0.00 -0.12 -0.05 -0.01 2 6 0.20 -0.07 0.00 -0.04 0.00 0.00 0.08 0.00 0.00 3 6 -0.20 0.03 0.00 0.05 0.09 0.00 -0.02 0.01 0.00 4 6 0.03 0.01 0.00 0.13 -0.04 0.00 0.01 0.00 0.00 5 7 0.08 -0.12 0.00 -0.16 -0.06 0.00 -0.02 0.02 0.00 6 1 -0.26 0.15 0.00 -0.14 0.70 0.00 -0.10 0.25 0.00 7 1 0.44 0.41 0.00 0.10 -0.09 0.00 -0.06 -0.06 0.00 8 7 -0.02 -0.11 0.00 -0.01 0.00 0.00 0.05 -0.04 0.00 9 1 -0.17 0.47 0.01 0.02 -0.11 0.00 -0.15 0.69 0.01 10 6 -0.07 0.11 0.00 0.00 0.03 0.00 0.04 -0.04 0.00 11 8 -0.09 -0.08 0.00 0.01 -0.04 0.00 0.01 0.04 0.00 12 1 0.12 -0.13 0.00 -0.61 0.04 0.00 -0.09 0.04 0.00 13 1 -0.09 0.20 -0.08 0.06 -0.04 0.02 0.31 -0.33 0.18 14 1 -0.13 0.11 -0.02 -0.05 -0.03 -0.01 0.15 -0.35 0.03 15 8 0.01 -0.01 0.00 -0.02 0.01 0.00 -0.02 0.02 -0.01 16 1 -0.01 0.00 0.00 -0.01 0.01 0.00 0.05 0.02 0.02 25 26 27 A A A Frequencies -- 1217.2539 1273.9628 1381.0685 Red. masses -- 1.1003 1.2965 2.1164 Frc consts -- 0.9606 1.2398 2.3783 IR Inten -- 706.6935 1450.3284 54.3276 Atom AN X Y Z X Y Z X Y Z 1 7 0.01 0.01 0.00 0.04 0.08 -0.01 0.10 0.11 0.00 2 6 0.00 -0.02 0.00 0.01 0.02 0.00 -0.14 0.04 0.00 3 6 0.01 0.01 0.00 0.01 0.00 0.00 -0.02 0.07 0.00 4 6 -0.05 -0.03 0.00 -0.04 -0.01 0.00 0.07 0.06 0.00 5 7 0.03 0.00 0.00 0.04 -0.04 0.00 0.00 -0.02 0.00 6 1 -0.16 0.52 0.00 -0.05 0.18 0.00 0.17 -0.52 0.00 7 1 -0.43 -0.41 0.01 -0.22 -0.18 0.00 -0.43 -0.42 0.01 8 7 0.02 0.01 0.00 -0.04 -0.01 0.00 0.03 -0.10 0.00 9 1 -0.03 0.18 0.00 0.07 -0.42 -0.01 -0.13 0.40 0.01 10 6 -0.02 -0.03 0.00 0.02 0.06 0.00 0.11 -0.07 0.00 11 8 0.02 0.00 0.00 -0.04 -0.01 0.00 -0.08 -0.03 0.00 12 1 0.35 -0.08 0.00 0.34 -0.11 0.00 -0.20 0.03 0.00 13 1 -0.22 0.24 -0.14 0.37 -0.40 0.28 0.10 0.04 -0.02 14 1 -0.01 0.23 0.01 -0.03 -0.41 -0.05 0.07 0.03 0.12 15 8 0.02 -0.01 0.01 -0.04 0.02 -0.01 -0.01 0.00 0.00 16 1 -0.04 -0.03 -0.01 0.09 0.06 0.02 -0.02 -0.05 0.01 28 29 30 A A A Frequencies -- 1406.2526 1413.8461 1465.9502 Red. masses -- 1.1855 1.8231 2.8701 Frc consts -- 1.3812 2.1471 3.6340 IR Inten -- 717.8644 110.7694 2.4285 Atom AN X Y Z X Y Z X Y Z 1 7 0.02 -0.02 0.00 -0.08 -0.04 0.00 0.04 0.06 0.00 2 6 -0.08 0.00 0.00 0.13 -0.01 0.00 -0.12 0.00 0.00 3 6 0.02 0.00 0.00 -0.04 0.10 0.00 0.12 -0.16 0.00 4 6 0.00 0.00 0.00 -0.04 -0.02 0.00 -0.19 0.01 0.00 5 7 0.00 -0.02 0.00 0.14 -0.03 0.00 0.11 0.04 0.00 6 1 0.04 -0.07 0.00 0.01 -0.05 0.00 -0.12 0.55 0.00 7 1 0.01 0.00 0.00 -0.31 -0.28 0.00 0.27 0.48 0.00 8 7 0.03 -0.01 0.00 -0.03 0.01 0.00 0.02 0.00 0.00 9 1 -0.05 0.27 0.00 0.06 -0.29 -0.01 -0.03 0.17 0.00 10 6 -0.03 0.06 0.00 0.06 0.03 0.00 0.18 -0.06 0.00 11 8 0.03 0.00 0.02 -0.05 0.00 0.01 -0.12 -0.03 0.00 12 1 0.09 -0.04 0.01 -0.71 0.18 0.00 -0.38 0.17 0.00 13 1 -0.22 -0.20 0.16 -0.14 -0.02 -0.03 -0.01 -0.02 0.00 14 1 -0.44 -0.04 -0.69 -0.17 0.10 -0.25 -0.03 0.11 -0.04 15 8 0.01 -0.01 0.02 0.02 -0.01 0.01 0.00 -0.01 0.00 16 1 0.12 0.32 -0.05 0.01 0.10 -0.03 0.00 0.02 -0.01 31 32 33 A A A Frequencies -- 1504.3943 1571.1641 1654.8166 Red. masses -- 2.6961 1.1791 1.3674 Frc consts -- 3.5951 1.7149 2.2062 IR Inten -- 251.1793 439.4111 211.6142 Atom AN X Y Z X Y Z X Y Z 1 7 0.03 -0.13 -0.01 -0.01 0.04 -0.02 -0.03 0.00 0.01 2 6 -0.12 0.03 0.00 0.02 -0.05 0.00 0.03 -0.03 0.00 3 6 0.05 0.05 0.00 -0.01 -0.01 0.00 -0.02 -0.02 0.00 4 6 -0.07 -0.05 0.00 0.02 0.02 0.00 0.04 0.04 0.00 5 7 0.13 -0.07 0.00 -0.02 0.01 0.00 -0.07 0.01 0.00 6 1 0.09 -0.05 0.00 -0.02 0.00 0.00 -0.02 -0.01 0.00 7 1 -0.01 -0.01 0.00 -0.02 -0.01 0.00 -0.03 -0.02 0.00 8 7 0.05 -0.02 0.00 -0.01 0.03 0.00 -0.01 0.02 0.00 9 1 -0.05 0.29 0.00 0.02 -0.02 0.00 0.01 -0.03 0.00 10 6 -0.10 0.25 0.00 0.01 -0.06 0.00 0.12 0.02 0.00 11 8 0.01 -0.02 -0.02 0.01 0.00 -0.01 -0.02 -0.01 -0.01 12 1 -0.14 0.00 0.00 -0.04 0.02 0.01 0.17 -0.05 0.00 13 1 -0.03 -0.13 0.20 -0.32 0.01 0.79 -0.29 -0.43 -0.29 14 1 -0.17 0.01 0.74 -0.11 0.21 0.25 -0.64 0.01 0.30 15 8 0.01 0.02 -0.04 0.00 -0.02 -0.05 0.05 0.03 0.00 16 1 0.04 -0.31 0.10 0.36 0.05 0.10 -0.17 -0.24 0.00 34 35 36 A A A Frequencies -- 1663.4051 1728.4444 1745.6312 Red. masses -- 4.7414 4.7383 3.5490 Frc consts -- 7.7296 8.3403 6.3718 IR Inten -- 210.5375 260.5465 858.8808 Atom AN X Y Z X Y Z X Y Z 1 7 -0.05 -0.04 -0.01 0.03 0.02 0.00 -0.07 -0.15 0.00 2 6 0.06 0.35 0.00 0.05 0.33 0.00 0.03 0.07 0.00 3 6 0.03 0.17 0.00 -0.01 -0.25 0.00 -0.03 -0.17 0.00 4 6 -0.07 -0.26 0.00 0.06 0.20 0.00 0.10 0.19 0.00 5 7 -0.08 0.08 0.00 0.07 -0.03 0.00 -0.08 -0.06 0.00 6 1 0.12 0.03 0.00 -0.19 0.25 0.00 -0.12 0.06 0.00 7 1 0.39 0.14 0.00 -0.25 -0.06 0.00 -0.23 -0.11 0.00 8 7 -0.02 -0.24 0.00 -0.03 -0.18 0.00 0.00 -0.01 0.00 9 1 -0.08 -0.18 0.00 -0.07 -0.18 0.00 0.00 -0.06 0.00 10 6 0.13 -0.01 0.00 -0.21 -0.11 0.00 0.17 0.24 0.00 11 8 -0.04 -0.02 0.00 0.10 0.04 0.00 -0.08 -0.06 0.00 12 1 0.44 -0.04 0.00 -0.44 0.09 0.00 0.19 -0.13 0.01 13 1 -0.27 0.07 0.20 -0.30 -0.14 -0.06 0.15 0.37 0.20 14 1 -0.01 0.36 0.00 -0.30 -0.20 0.13 0.38 0.47 -0.16 15 8 0.01 -0.02 -0.01 0.03 0.02 0.00 -0.03 -0.04 0.00 16 1 0.10 0.05 0.01 -0.04 -0.09 0.01 0.13 0.15 0.00 37 38 39 A A A Frequencies -- 2008.4310 3222.2227 3241.1164 Red. masses -- 1.0367 1.0880 1.0992 Frc consts -- 2.4639 6.6555 6.8031 IR Inten -- 122.8727 0.4981 8.1336 Atom AN X Y Z X Y Z X Y Z 1 7 -0.01 -0.02 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2 6 0.00 0.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3 6 0.00 0.00 0.00 -0.07 -0.02 0.00 0.05 0.02 0.00 4 6 0.00 0.00 0.00 0.03 -0.03 0.00 0.05 -0.06 0.00 5 7 -0.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6 1 0.00 0.01 0.00 0.79 0.26 -0.01 -0.52 -0.17 0.00 7 1 0.00 0.00 0.00 -0.38 0.39 0.00 -0.58 0.60 0.00 8 7 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 9 1 0.00 -0.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 10 6 0.03 -0.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 11 8 0.00 0.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 12 1 0.02 0.00 0.00 0.00 -0.01 0.00 0.00 -0.01 0.00 13 1 0.28 0.68 0.07 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 14 1 -0.54 -0.39 0.06 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 15 8 -0.01 -0.01 -0.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 16 1 0.07 -0.02 0.03 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 40 41 42 A A A Frequencies -- 3454.2607 3646.7679 3760.0038 Red. masses -- 1.0748 1.0787 1.0650 Frc consts -- 7.5561 8.4520 8.8709 IR Inten -- 3.8296 98.3808 40.4967 Atom AN X Y Z X Y Z X Y Z 1 7 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2 6 0.00 0.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3 6 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4 6 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5 7 0.00 0.00 0.00 -0.02 -0.07 0.00 0.00 0.00 0.00 6 1 0.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 7 1 0.00 0.00 0.00 -0.01 0.01 0.00 0.00 0.00 0.00 8 7 -0.07 -0.02 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 9 1 0.96 0.27 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 10 6 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 11 8 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 12 1 0.00 0.00 0.00 0.23 0.97 0.01 0.00 0.00 0.00 13 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.01 -0.01 14 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.01 -0.01 -0.01 15 8 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.02 -0.02 -0.05 16 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.37 0.31 0.87 gaussian还是好玩儿的 |
18楼2017-04-14 18:04:03
|
显摆一下虚频振动模式 见附件avi文件 |
» 本帖附件资源列表
-
欢迎监督和反馈：小木虫仅提供交流平台，不对该内容负责。
本内容由用户自主发布，如果其内容涉及到知识产权问题，其责任在于用户本人，如对版权有异议，请联系邮箱：xiaomuchong@tal.com - 附件 1 : ttt.avi
2017-04-14 18:12:36, 775 K
» 本帖已获得的红花（最新10朵）
wittymadder19楼2017-04-14 18:13:03
20楼2017-04-15 08:34:52
22楼2017-04-16 15:10:20
23楼2017-04-16 20:46:41
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
|
谈不上指教，注意一下结构合理性就是了 譬如你的这个结构中，=N-H弄成直线型就不合理了，很有可能虚频产生在这里，所以要调一下；儿水分子那块，注意未断O-H键的取向，不要妨碍水中O与H形成新的O-H键，当然也要考虑O上孤对的空间位置...... |
» 本帖已获得的红花（最新10朵）
24楼2017-04-18 13:19:46
25楼2017-04-18 13:22:37
26楼2017-04-18 13:25:12
27楼2017-04-19 08:03:11
简单回复
2017-04-14 12:21
回复
wittymadder(金币+1): 谢谢参与
纳米材料7535楼
2017-04-14 12:24
回复
wittymadder(金币+1): 谢谢参与
2017-04-14 12:30
回复
wittymadder(金币+1): 谢谢参与
2017-04-14 12:30
回复
wittymadder(金币+1): 谢谢参与
天涯20128楼
2017-04-14 12:52
回复
wittymadder(金币+1): 谢谢参与
laom20139楼
2017-04-14 13:00
回复
wittymadder(金币+1): 谢谢参与
yaoyao14510楼
2017-04-14 13:32
回复
wittymadder(金币+1): 谢谢参与
也是小白11楼
2017-04-14 14:03
回复
wittymadder(金币+1): 谢谢参与
。 发自小木虫Android客户端
spc0812楼
2017-04-14 14:12
回复
wittymadder(金币+1): 谢谢参与
paperhunter13楼
2017-04-14 14:19
回复
wittymadder(金币+1): 谢谢参与
tzynew14楼
2017-04-14 14:26
回复
wittymadder(金币+1): 谢谢参与
龙飞哥15楼
2017-04-14 14:30
回复
wittymadder(金币+1): 谢谢参与
祝福 发自小木虫Android客户端
aboluo19833116楼
2017-04-14 14:34
回复
wittymadder(金币+1): 谢谢参与
幸运观众17楼
2017-04-14 14:45
回复
wittymadder(金币+1): 谢谢参与
^_^ 发自小木虫IOS客户端
yyao_131421楼
2017-04-15 11:57
回复