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[交流]
优化过渡态最后结构变成了反应物/产物
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做的是胞嘧啶有一个水分子的质子转移。 不知道是不是过渡态的猜测有问题？ 改了几次结构都遇到了同样的问题，求解决方案。 |
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2017-04-14 07:51:37, 1.7 M
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显摆一下虚频振动模式 见附件avi文件 |
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2017-04-14 18:12:36, 775 K
» 本帖已获得的红花（最新10朵）
wittymadder19楼2017-04-14 18:13:03
|
输入文件~ %chk=(2)ts.chk # opt(ts,modred,maxstep=10,noeigen) freq b3lyp/6-31g(d) geom=connectivity Title Card Required 0 1 N 2.22669453 0.03792186 2.39529382 C 2.81457753 1.25264886 2.39529382 C 2.07134553 2.44892486 2.39529282 C 0.66838253 2.32599586 2.39526982 N 0.04909453 1.12698186 2.39532682 H 2.56122353 3.42839086 2.39529782 H 0.01315453 3.21532686 2.39527382 N 4.28452635 1.26491574 2.39526322 H 4.61391757 1.74069164 3.21082359 C 0.86558953 0.03792186 2.39529382 O 0.31665344 -1.05979222 2.39530095 H -0.94743943 1.04379496 2.39538940 H 3.03527727 -1.18585824 2.39529462 H 1.21906323 -1.99555745 2.39530703 O 2.31507774 -2.74744256 2.26623542 H 3.27507774 -2.74744256 2.26623542 1 2 1.0 10 1.0 2 3 1.0 8 2.0 3 4 2.0 6 1.0 4 5 1.0 7 1.0 5 10 1.0 12 1.0 6 7 8 9 1.0 9 10 11 2.0 11 12 13 14 15 16 1.0 16 |
2楼2017-04-14 07:55:01
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wittymadder(金币+1): 谢谢参与
wittymadder(金币+1): 谢谢参与
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结构弄成这样呢 N 2.22669453 0.03792186 2.39529382 C 2.81457753 1.25264886 2.39529382 C 2.07134553 2.44892486 2.39529282 C 0.66838253 2.32599586 2.39526982 N 0.04909453 1.12698186 2.39532682 H 2.56122353 3.42839086 2.39529782 H 0.01315453 3.21532686 2.39527382 N 4.28452635 1.26491574 2.39526322 H 4.61391757 1.74069164 3.21082359 C 0.86558953 0.03792186 2.39529382 O 0.31665344 -1.05979222 2.39530095 H -0.94743943 1.04379496 2.39538940 H 2.87570060 -1.04796506 2.39362767 H 0.91226613 -2.26366296 2.42272601 O 2.31173981 -2.51401207 2.39342120 H 2.61006309 -3.41164171 2.22951806 |
3楼2017-04-14 12:05:31
简单回复
也是小白11楼
2017-04-14 14:03
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wittymadder(金币+1): 谢谢参与
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