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huyx1970

铜虫 (初入文坛)

[交流] 哪位好心的虫虫能帮我看看这样的DNA能用?

提的DNA在4度冰箱里放了半年了,这是重新检测时跑的电泳图,哪位虫虫能帮我看看这样的DNA能否用?这样的带到底是怎么回事啊?是降解了吗?该怎样解决啊?如果重新提取的话,估计又得等半年多有了材料才能提取的啊,着急啊!!对了,DNA是用来做RAPD标记的。
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xiaoweiwei121

荣誉版主 (文坛精英)

这潭水蓝的深邃

优秀区长优秀区长优秀版主优秀版主

★
lwf991229(金币+1,VIP+0):感谢参与讨论,欢迎常来~
你这是点了多少微升跑的电泳啊
怎么这么亮
有的降解的比较严重
蛋白含量也比较高
那些主带很明显的还是可以用的
2楼2009-01-02 23:08:12
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huyx1970

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
Originally posted by xiaoweiwei121 at 2009-1-2 23:08:
你这是点了多少微升跑的电泳啊
怎么这么亮
有的降解的比较严重
蛋白含量也比较高
那些主带很明显的还是可以用的

版主,希望再能帮助解答:譬如前三个泳道里的能用吗?还有,很奇怪的是,大部分样,我事先用分光光度计检测时OD比值是1.8-2.0,所以是经RNA酶消化后才跑的样。
这么亮的原因,我自己怀疑是DNA浓度太高,而没有稀释的原因。DNA浓度大约500-2000,点样时DNA为5ul。
希望您能再费心解答!辛苦了!!
3楼2009-01-02 23:18:42
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sutao1979

木虫 (著名写手)

小木虫10年groupleader

★
lwf991229(金币+1,VIP+0):感谢参与讨论,~
点样孔亮说明含蛋白杂质,拖带说明含糖酚杂质,总DNA一般不容易降解,所以,还是可能是DNA不是很纯;浓度大杂质当然就多,低浓度跑一下看看;做RAPD要求模板纯度不是很高,可以试一试。
会当凌绝顶,一览众山小
4楼2009-01-03 01:07:11
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huyx1970

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
Originally posted by sutao1979 at 2009-1-3 01:07:
点样孔亮说明含蛋白杂质,拖带说明含糖酚杂质,总DNA一般不容易降解,所以,还是可能是DNA不是很纯;浓度大杂质当然就多,低浓度跑一下看看;做RAPD要求模板纯度不是很高,可以试一试。

谢谢指点啊!今天再试试!顺祝新年如意!
5楼2009-01-03 08:00:20
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spring0304

木虫 (小有名气)

拖带严重可能是DNA降解的太严重了
6楼2009-01-03 12:44:20
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zqt123_1981

木虫 (小有名气)

我也在做RAPD啊 ,我的DNA在-20放了半年 没啥事,你可以PCR试一下后面有啥问题可以交流啊 
7楼2009-01-03 20:40:32
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huyx1970

铜虫 (初入文坛)

谢谢各位热心解答了。将DNA稀释了10倍重新跑过,除个别条带没跑出来外,其余的还跑出来了(如图)。虽有降解和其它大分子物质残留,但应该还能用来PCR吧。
祝各位实验顺利啊!
8楼2009-01-04 08:06:47
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huyx1970

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
Originally posted by huyx1970 at 2009-1-4 08:06:
谢谢各位热心解答了。将DNA稀释了10倍重新跑过,除个别条带没跑出来外,其余的还跑出来了(如图)。虽有降解和其它大分子物质残留,但应该还能用来PCR吧。
祝各位实验顺利啊!

补充一点:有的条带浓是由于DNA模板没稀释到统一浓度啊。
9楼2009-01-04 08:08:22
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cherry3862

银虫 (小有名气)

用作PCR没问题的,主带都很明显的,你提的是不是组织DNA啊?应该是不纯的DNA,我也遇到过这种情况,不影响试验。
10楼2009-01-04 11:30:16
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