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zh1987hs

金虫 (著名写手)


[资源] 【分享】pymol教程

Pymol 0.99 版是免费且公开源码的三维分子显示、动画、编辑程序(但现在的1.0版本开始收费)

PyMOL是Python解释语言程序,用于分子图形实时显示,快速产生高清晰度的分子图像和动画。

  1. 优化的实时3D结构显示。
  2. 八种不同的分子模型显示方式。
  3. 读入标准的PDB,Macromodel,SDF,MOL,ChemPy格式文件。
  4. 读入X-PLOR和CCP4图文件,用于产生电子密度等势面图。
  5. 合并和拆分分子。
  6. 输出PDB,Macromodel,ChemPy格式的文件。
  7. 实时操作控制。
  8. 距离测量,任意加入标签。
  9. 裁减前后平面。
  10.鼠标控制模型的显示和操作。
  11.分子编辑工具。
  12.晶体学对称性,以及显示单元晶胞。
  13.球和表面的透明处理。
  14.显示选择原子的电子密度。
  15.分子重叠拟合。
  16.OpenGL硬件加速。
  17.不需要GUI的批处理工作模式。
本小虫也是最近才涉及这个,希望和大家多多交流
http://www.namipan.com/d/649e270129532c77774f11208716a741e812043053d48a00
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goldstar570

木虫 (职业作家)


★★★★★ 五星级,优秀推荐

谢谢分享 支持一个ie
10楼2009-07-22 13:38:15
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zh1987hs

金虫 (著名写手)


引用回帖:
Originally posted by huaxingjin at 2009-1-2 23:24:
学习啦!谢谢!

大家多多交流,哈哈,作为非专业人士,我们专业主要用pymol做蛋白对接小分子,之前可用swiss-model 做同源建模。可能在专业分子模拟的虫友看来比较没有技术含量,呵呵,希望得到各位大虫(咦?怎么像是老虎的别名?汗。。。)的指点
3楼2009-01-03 00:17:00
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yaohua009

木虫 (著名写手)


★★★★★ 五星级,优秀推荐

.........thanks
7楼2009-05-13 18:12:22
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★★★★★ 五星级,优秀推荐

★★★★★ 五星级
11楼2009-12-06 18:40:24
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