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Zzzlk

新虫 (初入文坛)

[求助] gromacs MD模拟 刚体问题 已有1人参与

我要进行分子动力学模拟,运用的工具是gromacs,老师让我把蛋白的一部分设置为刚体,但是这一部分是可以动的,只是这一部分结构内原子相对位置和速度都不变,各位大神,我应该怎么做。是不是要用索引文件设置分组,然后怎么办?

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jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)

可以试试把那一部分结构内部原子之间的键能设置大一些

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3楼2017-04-08 15:00:03
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XYwinne

金虫 (小有名气)

用位置限制,看手册,里面有详细解释!

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2楼2017-04-07 20:17:18
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crocodile5091

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

你能不能把软件发给我用一下
4楼2018-03-12 15:23:38
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