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萌蛋萌蛋

新虫 (小有名气)

[求助] 16srDNA测序后在BLAST里啥也显示不出来

本人是一只本科小虫,最近做毕设,利用16s鉴定17株细菌,是用了克隆那一套后,再拿阳性转化菌去测得序,标注了载体通用引物。测序结果显示成功,然后我不会用blast,师姐帮我试了一下,显示不出任何结果。各位生物学大神,我现在其实有两个问题特别不明白。一是筛选培养基里我确实加了氨苄了,浓度是老师要求的。但是我用一个不带载体的大肠杆菌涂在培养基上,边缘部分居然还是长出了点细菌,大小跟我其他17个培养基里长出来的差不多,我就特别担心都不带载体,可能氨苄多少有点失效。结果后来17个样品测序结果居然是成功,证明不是带的空载体。这里是不是有点奇怪呢?第二个问题是,我测序获得的16s序列为什么在blast上毫无结果,用了好几个样品都出不来结果,有没有其他方法还能试一下呢,好期待某个软件或网站能告诉我我的菌到底是哪个属的呀。谢谢各位大神,真的谢谢!

@gyesang 发自小木虫Android客户端
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萌蛋萌蛋

新虫 (小有名气)

是我太蠢了嘛,为什么没有大神搭理我

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2楼2017-04-05 12:15:29
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xuweitao

铁杆木虫 (著名写手)

把测序的序列贴上来看看吧,不知道你师姐的水平不好多评价。
3楼2017-04-06 08:41:39
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yijiewang

新虫 (初入文坛)

http://www.i-sanger.com/,这是我们公司开发的细菌多样性网站,你可以把数据传上去看看自己的菌属于那个种
4楼2017-04-12 21:49:23
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萌蛋萌蛋

新虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by xuweitao at 2017-04-06 08:41:39
把测序的序列贴上来看看吧,不知道你师姐的水平不好多评价。

多谢师姐,现在知道原因啦!

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5楼2017-07-23 20:47:39
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