24小时热门版块排行榜    

查看: 745  |  回复: 5
当前主题已经存档。
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

lh_1025

铁虫 (初入文坛)

[交流] 兼并引物设计

向论坛里的高手请教:

      我要克隆一个基因,现在已经在NCBI上找到其他物种的AA序列,通过比对后保守性比较低,最保守的才4个连续的AA残基,这样的片段仅有两到三个。我的问题是:根据这些保守的AA序列片段,如何能够保证所设计的兼并引物的Tm值,以及够确定这对引物合适呢?总不能仅仅将这两个AA片段翻译成核酸序列就可以了吧?
回复此楼

» 猜你喜欢

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

huhu5860

新虫 (初入文坛)

保守性这么低,我估计设计出的引物煎饼性太高根本没法用!
4楼2009-04-28 08:31:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 6 个回答

chuan2388

金虫 (小有名气)

好像做这方面的很少啊
把时间都浪费在自己身上吧!
3楼2009-04-28 07:46:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

DLLB

金虫 (小有名气)

之前做过这方面的实验,我的保守序列有六七个,但是还是没有得到完整基因。我是这样做的,希望对你有所帮助:查到保守氨基酸序列,从中选出相似物种的基因序列,以此为参考设计兼并引物,这样的话兼并性会小很多。但是我做PCR的时候还是有很多杂带,最后没有成功。
5楼2009-04-28 10:41:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

love_st

金虫 (著名写手)


几个序列一起比的?既然是表达同一蛋白的基因,AA上保守性应该比较强才对的,可以适当的减少比对的序列,一次比对太多我觉得结果不理想
6楼2009-04-28 14:00:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 086000生物与医药292求调剂 +4 小小陈小小 2026-03-22 7/350 2026-03-25 19:07 by 星空星月
[考研] 0854人工智能方向招收调剂 +4 章小鱼567 2026-03-24 4/200 2026-03-25 13:29 by 2177681040
[考研] 考研化学308分求调剂 +10 你好明天你好 2026-03-23 11/550 2026-03-25 10:23 by userper
[考研] 0703化学求调剂 +6 奶油草莓. 2026-03-22 7/350 2026-03-25 10:00 by shangxh
[考研] 318求调剂 +3 plum李子 2026-03-23 3/150 2026-03-25 09:42 by 雾散后相遇lc
[考研] 食品专硕 一志愿双一流 328 +3 xiaom99 2026-03-21 4/200 2026-03-24 21:20 by lailaisimei
[考研] 材料调剂 +6 匹克i 2026-03-23 6/300 2026-03-24 21:09 by greychen00
[考研] 材料292调剂 +8 橘颂思美人 2026-03-23 8/400 2026-03-24 16:33 by laoshidan
[考研] 300求调剂,材料科学英一数二 +5 leaflight 2026-03-24 5/250 2026-03-24 16:25 by laoshidan
[考研] 307求调剂 +3 余意卿 2026-03-21 6/300 2026-03-24 15:03 by 余意卿
[基金申请] 请教下大家 2026年国家基金申请是双盲审吗? +3 lishucheng1 2026-03-22 5/250 2026-03-24 08:22 by gltch
[考研] 材料/农业专业,07/08开头均可,过线就行 +3 呵唔哦豁 2026-03-23 4/200 2026-03-23 22:30 by 汪!?!
[考研] 350求调剂 +6 weudhdk 2026-03-19 6/300 2026-03-23 15:47 by tangyuan0840221
[考研] 276求调剂 +3 YNRYG 2026-03-21 4/200 2026-03-23 08:31 by 醉在风里
[考研] 一志愿北京化工大学070300 学硕336求调剂 +5 vv迷 2026-03-21 8/400 2026-03-22 14:20 by ColorlessPI
[考研] 初试 317 +7 半拉月丙 2026-03-20 7/350 2026-03-21 22:26 by peike
[考研] 南昌大学材料专硕311分求调剂 +6 77chaselx 2026-03-20 6/300 2026-03-21 07:24 by JourneyLucky
[考研] 329求调剂 +9 想上学吖吖 2026-03-19 9/450 2026-03-20 22:01 by luoyongfeng
[考研] 中南大学化学学硕337求调剂 +3 niko- 2026-03-19 6/300 2026-03-20 21:58 by luoyongfeng
[考研] 一志愿西南交通 专硕 材料355 本科双非 求调剂 +5 西南交通专材355 2026-03-19 5/250 2026-03-20 21:10 by JourneyLucky
信息提示
请填处理意见