24小时热门版块排行榜    

北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
查看: 748  |  回复: 5
当前主题已经存档。
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

lh_1025

铁虫 (初入文坛)

[交流] 兼并引物设计

向论坛里的高手请教:

      我要克隆一个基因,现在已经在NCBI上找到其他物种的AA序列,通过比对后保守性比较低,最保守的才4个连续的AA残基,这样的片段仅有两到三个。我的问题是:根据这些保守的AA序列片段,如何能够保证所设计的兼并引物的Tm值,以及够确定这对引物合适呢?总不能仅仅将这两个AA片段翻译成核酸序列就可以了吧?
回复此楼

» 猜你喜欢

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

huhu5860

新虫 (初入文坛)

保守性这么低,我估计设计出的引物煎饼性太高根本没法用!
4楼2009-04-28 08:31:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 6 个回答

chuan2388

金虫 (小有名气)

好像做这方面的很少啊
把时间都浪费在自己身上吧!
3楼2009-04-28 07:46:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

DLLB

金虫 (小有名气)

之前做过这方面的实验,我的保守序列有六七个,但是还是没有得到完整基因。我是这样做的,希望对你有所帮助:查到保守氨基酸序列,从中选出相似物种的基因序列,以此为参考设计兼并引物,这样的话兼并性会小很多。但是我做PCR的时候还是有很多杂带,最后没有成功。
5楼2009-04-28 10:41:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

love_st

金虫 (著名写手)


几个序列一起比的?既然是表达同一蛋白的基因,AA上保守性应该比较强才对的,可以适当的减少比对的序列,一次比对太多我觉得结果不理想
6楼2009-04-28 14:00:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 一志愿哈尔滨工业大学材料与化工方向336分 +9 辰沐5211314 2026-03-26 9/450 2026-03-29 01:12 by 我是小康
[考研] 求调剂 +7 争取九点睡 2026-03-28 8/400 2026-03-28 21:07 by 争取九点睡
[考研] 343求调剂 +5 爱羁绊 2026-03-28 5/250 2026-03-28 20:53 by 唐沐儿
[考研] 压国家一区线,求导师收留,有恩必谢! +7 迷人的哈哈 2026-03-28 7/350 2026-03-28 16:47 by 催化大白
[考研] 材料与化工272求调剂 +9 阿斯蒂芬2004 2026-03-28 9/450 2026-03-28 15:21 by 1018329917
[考研] 一志愿中南大学化学0703总分337求调剂 +5 niko- 2026-03-27 5/250 2026-03-28 14:25 by 唐沐儿
[考研] 0703化学 +10 妮妮ninicgb 2026-03-27 10/500 2026-03-28 14:07 by 哒哒哒呱呱呱
[考研] 一志愿南昌大学324求调剂 +7 hanamiko 2026-03-27 7/350 2026-03-28 09:56 by 李上岸0921
[考研] 材料求调剂 一志愿哈工大总分298分,前三科223分 +5 dongfang59 2026-03-27 5/250 2026-03-28 04:53 by wxiongid
[考研] 0703化学求调剂,各位老师看看我!!! +5 祁祺祺 2026-03-25 5/250 2026-03-27 21:44 by 东方猪猪
[考研] 266求调剂 +11 阳阳哇塞 2026-03-27 12/600 2026-03-27 17:56 by yu221
[考研] 272求调剂 +7 脚滑的守法公民 2026-03-27 7/350 2026-03-27 17:23 by laoshidan
[考研] 333求调剂 +3 question挽风 2026-03-23 3/150 2026-03-27 11:29 by 不吃魚的貓
[考研] 材料学硕,求调剂 6+5 糖葫芦888ll 2026-03-22 10/500 2026-03-27 08:18 by hypershenger
[考研] 325求调剂 +3 Aoyijiang 2026-03-23 3/150 2026-03-26 20:46 by 不吃魚的貓
[考研] 081700 调剂 267分 +11 迷人的哈哈 2026-03-23 11/550 2026-03-26 15:41 by zzll406
[考研] 【2026考研调剂】制药工程 284分 求相关专业调剂名额 +4 袁奂奂 2026-03-25 8/400 2026-03-25 14:32 by lbsjt
[考研] 293求调剂 +7 加一一九 2026-03-24 7/350 2026-03-25 12:02 by userper
[考研] 318求调剂 +3 plum李子 2026-03-23 3/150 2026-03-25 09:42 by 雾散后相遇lc
[论文投稿] 急发核心期刊论文 +3 贤达问津 2026-03-23 5/250 2026-03-23 17:13 by 妹子不好惹
信息提示
请填处理意见