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fengrui826新虫 (小有名气)
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AMBER14进行分解自由能计算遇到问题 已有1人参与
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大家好！我在用amber14进行分解自由能计算时出现如下错误： File "/home/dell/myname/amber14/bin/MMPBSA.py", line 113, in <module> app.write_final_outputs() File"/home/dell/myname/amber14/lib/python2.7/site-packages/MMPBSA_mods/main.py", line 643, in write_final_outputs self.normal_system, self.mutant_system, self.mut_str, self.pre) File"/home/dell/myname/amber14/lib/python2.7/site-packages/MMPBSA_mods/output_file.py", line 672, in write_decomp_binding_output gb_bind.parse_all() File "/home/dell/myname/amber14/lib/python2.7/site-packages/MMPBSA_mods/amber_outputs.py", line 2112, in _parse_all_csv self._parse_all_begin() File "/home/dell/myname/amber14/lib/python2.7/site-packages/MMPBSA_mods/amber_outputs.py", line 1956, in _parse_all_begin raise DecompError('Mismatch in number of decomp terms!') DecompError: Mismatch in number of decomp terms! Exiting. All files have been retained. 我的输入文件mmpbsa.in内容是: Per-residue GB and PB dexomposition &general startframe=1, endframe=50, verbose=1, / &gb igb=5, saltcon=0.100, / &pb istrng=0.100, / &decomp idecomp=1, dec_verbose=1, print_res="266; 267" / 想问前辈们该问题如何解决？谢谢！ |
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5楼2017-03-24 20:07:13