| 查看: 1896 | 回复: 5 | ||
fengrui826新虫 (小有名气)
|
[求助]
AMBER14进行分解自由能计算遇到问题 已有1人参与
|
|
大家好！我在用amber14进行分解自由能计算时出现如下错误： File "/home/dell/myname/amber14/bin/MMPBSA.py", line 113, in <module> app.write_final_outputs() File"/home/dell/myname/amber14/lib/python2.7/site-packages/MMPBSA_mods/main.py", line 643, in write_final_outputs self.normal_system, self.mutant_system, self.mut_str, self.pre) File"/home/dell/myname/amber14/lib/python2.7/site-packages/MMPBSA_mods/output_file.py", line 672, in write_decomp_binding_output gb_bind.parse_all() File "/home/dell/myname/amber14/lib/python2.7/site-packages/MMPBSA_mods/amber_outputs.py", line 2112, in _parse_all_csv self._parse_all_begin() File "/home/dell/myname/amber14/lib/python2.7/site-packages/MMPBSA_mods/amber_outputs.py", line 1956, in _parse_all_begin raise DecompError('Mismatch in number of decomp terms!') DecompError: Mismatch in number of decomp terms! Exiting. All files have been retained. 我的输入文件mmpbsa.in内容是: Per-residue GB and PB dexomposition &general startframe=1, endframe=50, verbose=1, / &gb igb=5, saltcon=0.100, / &pb istrng=0.100, / &decomp idecomp=1, dec_verbose=1, print_res="266; 267" / 想问前辈们该问题如何解决？谢谢！ |
回复此楼» 猜你喜欢
2026国自然函评费到账
已经有18人回复
-
建议基金发布提前给出明确的时间点
已经有15人回复
-
范进中举一文的中心思想
已经有7人回复
-
朋友圈看到的
已经有9人回复
-
能否退出参与的面上项目解除限项
已经有13人回复
-
让我中一个面上吧！
已经有16人回复
-
放榜前的不淡定
已经有17人回复
-
科研孤儿太难了
已经有19人回复
-
明天应该可查了！？
已经有4人回复
-
什么时候开奖？
已经有11人回复
lyfxie8607
木虫 (著名写手)
- 应助: 24 (小学生)
- 金币: 6391
- 散金: 3081
- 红花: 17
- 帖子: 1778
- 在线: 568.7小时
- 虫号: 611974
- 注册: 2008-09-25
- 性别: GG
- 专业: 合成药物化学
2楼2017-03-23 15:57:00
fengrui826
新虫 (小有名气)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 693.5
- 散金: 99
- 红花: 3
- 帖子: 198
- 在线: 69.9小时
- 虫号: 3743144
- 注册: 2015-03-16
- 专业: 植物化学保护
3楼2017-03-23 16:10:33
lyfxie8607
木虫 (著名写手)
- 应助: 24 (小学生)
- 金币: 6391
- 散金: 3081
- 红花: 17
- 帖子: 1778
- 在线: 568.7小时
- 虫号: 611974
- 注册: 2008-09-25
- 性别: GG
- 专业: 合成药物化学
4楼2017-03-24 15:10:03
fengrui826
新虫 (小有名气)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 693.5
- 散金: 99
- 红花: 3
- 帖子: 198
- 在线: 69.9小时
- 虫号: 3743144
- 注册: 2015-03-16
- 专业: 植物化学保护
5楼2017-03-24 20:07:13
6楼2018-12-19 10:14:58
