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想飞的fish

新虫 (小有名气)

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[交流] 投票选出世界上最有趣的基因组！

近日，Pacbio科学家评论员团队已通过考评从数百份提交资料中筛选出五强候选者入围-2017年“SMRT Grant Program”，现在欢迎社会各界投票选择你们最喜欢的项目，帮助选取最终的胜出者，截止到4月5日！ “SMRT Grant Program”获奖者将获得由PacBio和其合作伙伴亚利桑那基因组学研究所赞助的SMRT测序和基因组装配或Iso-Seq分析。
Project: Dancing with Dingoes
主要研究者： Bill Ballard, University of New South Wales; Claire Wade, University of Sydney, Sydney, Australia
Project: Explosive Beetle
主要研究者：Tanya Renner, San Diego State University; Aman Gill, University of California, Berkeley; Wendy Moore, University of Arizona; Kipling Will, University of California, Berkeley; Athula Attygalle, Stevens Institute of Technology
Project: Pink Pigeon
主要研究者：Matthew Clark, Earlham Institute; Cock Van Oosterhout, University of East Anglia
Project: Solar-powered Slug
主要研究者： Carola Greve, Zoological Research Museum A. Koenig; Alexander Donath, Zoological Research Museum A. Koenig
Project: Temple Pitviper
主要研究者： Mrinalini Mrinalini, National University of Singapore; Ryan McCleary, Utah State University; Manjunatha Kini, National University of Singapore
            http://www.pacb.com/smrt-science/smrt-grant/pag2017/，为你支持的项目投上一票！
   为什么对于SMRT测序，全世界的科学家如此铁粉，那么就让小编我为大家一一解读吧
SMRT技术原理
该测序也是基于边合成边测序的原理，这项技于使用了Zero-ModeWaveguide(ZMW)(零级波导)。测序的过程：被荧光标记磷酸集团的核苷酸在聚合酶活性位点上与模板链结合（每种脱氧核苷酸被不用颜色的染料标记），被激发出荧光，在荧光脉冲结束后，被标记的磷酸集团被切割并释放，聚合酶转移到下一个位置，下一个脱氧核苷酸连接到位点上开始释放荧光脉冲，进行下一个循环。
SMRT技术特点
1  利用测序过程聚合酶反应的动力学变化，首次实现对碱基修饰进行直接测序。
2 超长的读长：平均测序读长能达到7,000-8,000bp，最长读长能达到3,0000bp；
3  准确率高：对基因组组装和基因组变异检测，可以最多达到99.999%的准确率；
4敏感性强：可以检测频率在0.1%的minor variants；
5 无PCR扩增偏好性：样本不需要进行PCR扩增，避免了覆盖度不均一和PCR artifacts；
6最小的GC偏好性（GC bias）：在极端高GC和极端低GC区域，可以轻松测定，从而保证序列的均匀覆盖度。
关于天津生物芯片
   天津生物芯片三代测序平台自2013年运行至今，作为国内最早一批提供三代测序服务的机构，现已成功利用三代测序技术完成细菌、真菌、昆虫、动植物、人类等数百个物种的基因组、全长转录组测序及分析工作，并开发建立了基于三代测序技术的靶向测序、宏基因组测序、表观遗传测序、以及单细胞测序系列方案。天津生物芯片于2016年9月，又率先引进了Pacific Biosciences公司最新推出的三代测序旗舰平台——Sequel。
      Sequel平台在PacBio RS II的基础上作了全面系统地升级，在读长、通量和准确率等方面都具有显著优势，升级后的系统更能满足大数据量、多倍体以及复杂基因组学研究的需求。
无需扩增，不会人为地引入突变 ·
超长读长，平均读长可达到11Kb，最长读长可以达到40Kb ·
覆盖均匀，无GC偏好性 ·
通过reads的自我矫正，10X以上准确率能够达到99.999% ·
可以直接检测到甲基化信息，同步进行表观遗传学识别。
2017年4月1日前订购Sequel三代测序服务，即享多重优惠！

五个候选项目.jpg

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