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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 【交流】过渡态
北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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liuxiaocunde

铁杆木虫 (著名写手)

古德里安将军

[交流] 【交流】过渡态

我最近想尝试使用GAUSSIAN来进行反应的过渡态计算，可是之前从未接触过GAUSSIAN，最近掌握了一些最基础的东西，虫子们有哪位做的好的，能不能指导一下，我接下来该怎么做呢？
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新征途
1楼 2008-12-26 20:04:09
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hbinjm

木虫 (著名写手)

小柔的爸
★ ★
jghe(金币+2,VIP+0):感谢你参与讨论！
推荐你一片08年最新的文献：
del Campo JM, Koster AM. A hierarchical transition state search algorithm. Journal of Chemical Physics, 2008, 129(2): 12.
文献后面有96篇参考文献，值得仔细研究
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无
2楼2008-12-27 02:05:05
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0312103899

金虫 (小有名气)
★ ★ ★
jghe(金币+2,VIP+0):感谢你参与讨论！
yjcmwgk(金币+1,VIP+0): 10-15 16:36
论坛上有些GAUSSIAN说明书，你搜搜看看，有帮助。具体来说有两种方法优化构型。一种在linux并行机组中计算，另一种就是在win下计算。它们两种只是方式的不同，以及词头格式的不同，运算速度没什么差异。
首先就是用gaussview（win模式下，或者molden（linux模式下）软件建立构型。只要键角键长原子数没有差错，输入机子就可进行计算。
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3楼2008-12-28 20:36:20
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wuhanhgf2002

金虫 (正式写手)
★
lei0736(金币+1,VIP+0):谢谢
先学用高斯怎样做优化。
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4楼2008-12-29 08:25:58
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09810025

铁虫 (正式写手)

求助过渡态搜索，纯新手

★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
我对于量子化学基本不懂，最近刚接触，想进行过渡态搜索。
请问用hyperchem建立构型后，输出文件用gs打开后还有些什么操作。
我画好后输入gs，我看到论坛上面 输入#MP2/6-311G** opt=qst2 freq是什么意思。
最好详细一点，qst2 和qst3 都不是很明白。
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5楼2009-10-14 09:25:35
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yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)

密度泛函·小卒

优秀版主
★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
lei0736(金币+3,VIP+0):谢谢 10-25 11:49
引用回帖:
Originally posted by 09810025 at 2009-10-14 09:25:
我对于量子化学基本不懂，最近刚接触，想进行过渡态搜索。
请问用hyperchem建立构型后，输出文件用gs打开后还有些什么操作。
我画好后输入gs，我看到论坛上面 输入#MP2/6-311G** opt=qst2 freq是什么意思。
最 ...

看您这还真是无畏啊
什么问题都能问
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=1405684
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=1566146
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6楼2009-10-14 10:35:33
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majun04

木虫 (著名写手)

majun
★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
lei0736(金币+3,VIP+0):谢谢 10-25 11:49
“我最近想尝试使用GAUSSIAN来进行反应的过渡态计算，可是之前从未接触过GAUSSIAN，最近掌握了一些最基础的东西，”

先尝试以下exploring书上的例题，自己先看一下过渡态是什么样子，怎么算出来的，输出结果都有什么信息。
然后到网上搜一下文献，看那些个专门计算反应路径的文章，很多，基本上每篇这样的文章都是讨论过渡态、能垒，以及前线轨道，然后给出最优反应路径的。这样的文章一般有“Supporting Info”，这个部分会给出具体的过渡态的结构，你也可以尝试着重复人家的文献。慢慢的就摸索出门道了。
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乐观、执着、勤奋
7楼2009-10-14 22:56:05
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wh-32290

铁虫 (小有名气)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
yjcmwgk(金币+1,VIP+0): 10-15 16:37
qst2是通过反应物和产物由软件计算过渡态
qst3是给出反应物和产物及猜想过渡态进行计算
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8楼2009-10-15 01:19:41
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09810025

铁虫 (正式写手)

谢谢，还在摸索中

★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
最近正在学习那本exploring chemistry...
很奇怪的是那里有些exercise在gs里面计算的时候竟然link died。可是换了台电脑好像又可以了重复几次都是一样的，如3-07.
不过现在对概念熟悉了很多，感谢小木虫
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9楼2009-10-24 21:08:14
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467266420

铁杆木虫 (著名写手)
★ ★
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢 10-30 20:37
看下小木虫的这个链接三
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=1491020&fpage=1
好东西啊！
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10楼2009-10-30 18:53:28
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