应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

CyRhmU.jpeg
小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 【交流】过渡态
101/1返回列表
查看: 1395  |  回复: 9
只看楼主@他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前主题已经存档。

liuxiaocunde

铁杆木虫 (著名写手)

古德里安将军

[交流] 【交流】过渡态

我最近想尝试使用GAUSSIAN来进行反应的过渡态计算，可是之前从未接触过GAUSSIAN，最近掌握了一些最基础的东西，虫子们有哪位做的好的，能不能指导一下，我接下来该怎么做呢？
回复此楼

» 猜你喜欢
新征途
1楼2008-12-26 20:04:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hbinjm

木虫 (著名写手)

小柔的爸
★ ★
jghe(金币+2,VIP+0):感谢你参与讨论！
推荐你一片08年最新的文献：
del Campo JM, Koster AM. A hierarchical transition state search algorithm. Journal of Chemical Physics, 2008, 129(2): 12.
文献后面有96篇参考文献，值得仔细研究
赞一下(10人) 回复此楼
无
2楼2008-12-27 02:05:05
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

0312103899

金虫 (小有名气)
★ ★ ★
jghe(金币+2,VIP+0):感谢你参与讨论！
yjcmwgk(金币+1,VIP+0): 10-15 16:36
论坛上有些GAUSSIAN说明书，你搜搜看看，有帮助。具体来说有两种方法优化构型。一种在linux并行机组中计算，另一种就是在win下计算。它们两种只是方式的不同，以及词头格式的不同，运算速度没什么差异。
首先就是用gaussview（win模式下，或者molden（linux模式下）软件建立构型。只要键角键长原子数没有差错，输入机子就可进行计算。
赞一下(20人) 回复此楼
3楼2008-12-28 20:36:20
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wuhanhgf2002

金虫 (正式写手)
★
lei0736(金币+1,VIP+0):谢谢
先学用高斯怎样做优化。
赞一下(10人) 回复此楼
4楼2008-12-29 08:25:58
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

09810025

铁虫 (正式写手)

求助过渡态搜索，纯新手

★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
我对于量子化学基本不懂，最近刚接触，想进行过渡态搜索。
请问用hyperchem建立构型后，输出文件用gs打开后还有些什么操作。
我画好后输入gs，我看到论坛上面 输入#MP2/6-311G** opt=qst2 freq是什么意思。
最好详细一点，qst2 和qst3 都不是很明白。
赞一下(1人) 回复此楼
5楼2009-10-14 09:25:35
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)

密度泛函·小卒

优秀版主
★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
lei0736(金币+3,VIP+0):谢谢 10-25 11:49
引用回帖:
Originally posted by 09810025 at 2009-10-14 09:25:
我对于量子化学基本不懂，最近刚接触，想进行过渡态搜索。
请问用hyperchem建立构型后，输出文件用gs打开后还有些什么操作。
我画好后输入gs，我看到论坛上面 输入#MP2/6-311G** opt=qst2 freq是什么意思。
最 ...

看您这还真是无畏啊
什么问题都能问
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=1405684
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=1566146
赞一下(11人) 回复此楼
6楼2009-10-14 10:35:33
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

majun04

木虫 (著名写手)

majun
★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
lei0736(金币+3,VIP+0):谢谢 10-25 11:49
“我最近想尝试使用GAUSSIAN来进行反应的过渡态计算，可是之前从未接触过GAUSSIAN，最近掌握了一些最基础的东西，”

先尝试以下exploring书上的例题，自己先看一下过渡态是什么样子，怎么算出来的，输出结果都有什么信息。
然后到网上搜一下文献，看那些个专门计算反应路径的文章，很多，基本上每篇这样的文章都是讨论过渡态、能垒，以及前线轨道，然后给出最优反应路径的。这样的文章一般有“Supporting Info”，这个部分会给出具体的过渡态的结构，你也可以尝试着重复人家的文献。慢慢的就摸索出门道了。
赞一下(11人) 回复此楼
乐观、执着、勤奋
7楼2009-10-14 22:56:05
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wh-32290

铁虫 (小有名气)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
yjcmwgk(金币+1,VIP+0): 10-15 16:37
qst2是通过反应物和产物由软件计算过渡态
qst3是给出反应物和产物及猜想过渡态进行计算
赞一下(11人) 回复此楼
8楼2009-10-15 01:19:41
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

09810025

铁虫 (正式写手)

谢谢，还在摸索中

★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
最近正在学习那本exploring chemistry...
很奇怪的是那里有些exercise在gs里面计算的时候竟然link died。可是换了台电脑好像又可以了重复几次都是一样的，如3-07.
不过现在对概念熟悉了很多，感谢小木虫
赞一下(1人) 回复此楼
9楼2009-10-24 21:08:14
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

467266420

铁杆木虫 (著名写手)
★ ★
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢 10-30 20:37
看下小木虫的这个链接三
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=1491020&fpage=1
好东西啊！
赞一下(10人) 回复此楼
10楼2009-10-30 18:53:28
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 liuxiaocunde 的主题更新
101/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复(可上传附件)
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭