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jjf_sxnu

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[交流] 【求助】模拟分子的分解

小弟有一个问题，想模拟一个分子（大根有120个原子）在加热到多少K的时候会分解，请问用什么软件，怎么可以实现，越详细越好，小弟我以前从未接触过分子动力学，所以是个菜鸟。

[ Last edited by zdhlover on 2009-12-11 at 15:57 ]

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1楼 2008-12-24 10:30:38

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gwdavid

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yyx19840628(金币+3,VIP+0):谢谢交流

凡是涉及到化学反应的问题都要用量子力学的方法解决，分子动力学是基于分子力学的模拟非键过程体系运动的方式，肯定是不适合你的问题的

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个人博客：[url]http://blog.sina.com.cn/gaiwei[/url]

2楼2008-12-24 12:50:43

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minmin_0082003

金虫 (正式写手)

莫愁莫愁

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★ ★ ★
yyx19840628(金币+3,VIP+0):谢谢交流

偶认为用高斯的MD就可以
不过你的计算机性能要足够好
找到分子分解时候的过渡态
看他的能量有多高
一般20个千卡左右表示常温就可以反应也就是25摄氏度，超过20 ，每增加5个千卡好像是升温20度（有具体的换算方式，既不清楚了）

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3楼2008-12-24 14:52:23

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jjf_sxnu

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引用回帖:

Originally posted by gwdavid at 2008-12-24 12:50:
凡是涉及到化学反应的问题都要用量子力学的方法解决，分子动力学是基于分子力学的模拟非键过程体系运动的方式，肯定是不适合你的问题的

我也是看了一篇文献才有这个想法的，就是用分子动力学实现的。 J. Computaional Chemistry . vol. 24, No. 8 page 948

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4楼2008-12-24 15:05:42

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Ben9908

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★
lei0736(金币+1,VIP+0):谢谢鼓励新人圣诞快乐

我认为动力学模拟可以，时间步长大一点

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5楼2008-12-24 16:08:08

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bay__gulf

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刘苏州

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★
jghe(金币+1,VIP+0):感谢你参与讨论！

如果有了处理键的生成和断裂过程的力场，模拟化学反应也没有问题。但通用力场好像没有处理这个的。
有个叫分子反应动力学的东东，听说过没碰过

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6楼2008-12-28 12:55:41

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jjf_sxnu

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不知道第一性原理动力学能不能解决这个问题？

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7楼2008-12-28 15:50:02

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wuhanhgf2002

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lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢

用高斯做从头算分子动力学。

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8楼2008-12-29 08:30:34

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lei0736

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比如最近我了解到的DELPHI实验室的一个牛人就算了一个单个氧分子的解离得到两体势也就是有了力场那么将这个两体势加上分子与分子之间的两体势如LJ势自然可以模拟你这个过程也就是说经典的分子动力学可以做到
问题的关键是像这样的两体势很难得到要做大量计算而且结构复杂的话就基本不可能了建议还是用第一原理的分子动力学吧

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9楼2008-12-29 10:12:42

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