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wuhanhgf2002

金虫 (正式写手)

[交流] 【求助】关于分子连接的软件

求助,请问有谁知道用什么软件可以把某两个或多个小分子的pdb或mol2文件连接起来组成新的分子mol2或pdb文件的软件。谢谢

[ Last edited by zdhlover on 2009-12-11 at 16:08 ]
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yalefield

金虫 (文坛精英)

老汉一枚


xuefei06(金币+1,VIP+0):谢谢你的参与,欢迎你多多关注计算综合版!
引用回帖:
Originally posted by whitewatercn at 2008-12-23 15:58:
楼上的都是要钱的, 俺给你推荐一个开源的小工具
SmiLib: A Java-Based Tool for Rapid Combinatorial Library Enumeration

请看
http://gecco.org.chemie.uni-frankfurt.de/smilib/index.html

很好很强大
要是再找不着这样的东西,就得逼着老汉亲自动手写代码了。
9楼2008-12-23 18:46:27
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yalefield

金虫 (文坛精英)

老汉一枚

★ ★
mingdong(金币+1,VIP+0):谢谢您的帮助
wuhanhgf2002(金币+1,VIP+0):谢谢老汉
(1)记事本(Windows附赠)
(2)Crimson Editor(开源、免费)
(3)UltraEdit, EditPlus(共享)
...
2楼2008-12-23 05:58:20
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wuhanhgf2002

金虫 (正式写手)

不是这个,您误会我的意思了,我说的软件是可以自动的把两个pdb或mol2通过单键或双键,在选定的连接位点基础上组成新的分子,这个软件可以自动批量的连接若干个分子。
3楼2008-12-23 07:51:08
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wuhanhgf2002

金虫 (正式写手)

gview也不行啊,比方说,我有50个分子,想通过某个软件和另外20个分子用单键连接,提前定义每个分子的连接位点,这样的话用排列组合,就会生成1000个新的分子。Gview可以实现吗?
5楼2008-12-23 10:42:55
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