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求助,怎么比对多个氨基酸序列两两之间的的相似度? 已有3人参与
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因为我所做的家族中含有20+的基因,想比较一下他们之间的相似度,如何操作呢?NCBI上的两两比对太慢,有没有那种类似于clustalw那种比对,一次性比对,出来一个数值化的结果。我是新人,不懂生物信息学,求高人告知,最好说的详细一点,非常感谢。ps.我没有多少金币,没法发求助帖。 |
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4楼2017-02-19 11:42:46
gyesang
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西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2017-02-19 08:35:12
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就用clustalw网页版的比对程序来做,会给你结果统计图,给你两两的相似度值,这个程序是EBI的,你可以clustal omega 发自小木虫IOS客户端 |
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2楼2017-02-19 02:07:47
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西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2017-02-19 08:35:24
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西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2017-02-19 08:35:24
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这份需要建树,对比然后做一个evolutionary tree。看谁跟谁相近。我几年前做过,现在不知道什么软件最合适了。你查一下文献 发自小木虫IOS客户端 |

3楼2017-02-19 07:31:23
5楼2017-02-19 15:08:22













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xdbotany