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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 干扰/敲除 » CRISPR/Cas9技术敲除原核生物的基因如何设计sgRNA
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075003

新虫 (初入文坛)

[交流] CRISPR/Cas9技术敲除原核生物的基因如何设计sgRNA已有7人参与

新人求指教
有人用CRISPR/Cas9技术敲除原核生物的基因吗？  如何设计sgRNA ？ 用什么软件设计sgRNA ？脱靶效应如何评估？
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1楼2017-01-30 20:48:38
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稻草人2011

铁杆木虫 (正式写手)
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引用回帖:
3楼: Originally posted by drwhoknowss at 2017-02-15 10:31:49
cas-offinder是最好的

你好，请问用Cas-OFFinder设计好了sgRNA后，如何评估sgRNA的脱靶效应呢; Bulge Type, Bulge Size, Mismatch, Number of Found Targets应该是多少会比较好呢？因为之前没有接触过CRISPR/Cas9，有很多不懂的地方，还请多多指教，谢谢啦~
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9楼2018-01-24 10:54:27
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稻草人2011

铁杆木虫 (正式写手)
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引用回帖:
10楼: Originally posted by drwhoknowss at 2018-01-24 11:03:10
很久以前的回复了啊。还有人。。。
Cas-OFFinder就能评估，原则是Number of Found Targets越少越好，最好<5.
<10也行。其他比较次要。
Cas-OFFinder比较好的地方是，off-targets找得准...

因为一直有新手啊
好的，谢谢您的解答
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11楼2018-01-24 15:21:09
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