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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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msr111111

木虫 (小有名气)

[求助] calypso 结构预测求助

calypso 结构预测求助
利用同一个账号提交两个任务，先提交的任务老是处于排队中，而后提交的任务立刻就开始计算！第一个任务排队，都排几天了，觉得可能是自己提交的脚本有问题！
提交作业后显示的信息：
node10:
                                                                         Req'd  Req'd   Elap
Job ID               Username Queue    Jobname          SessID NDS   TSK Memory Time  S Time
-------------------- -------- -------- ---------------- ------ ----- --- ------ ----- - -----
732.inode10          bryu     normal1  vasp_template       --      2  48    --  9999: Q   --
    --
[bryu@node10 calypso]$

脚本如下：
                     test.pbs
#!/bin/sh
#PBS -N vasp_template
#PBS -j oe

#PBS -l nodes=2:ppn=24,walltime=9999:00:00

#PBS -V
#################################################################
#......you only need to modify the filename of these line.......#
#............or add lines similar as these......................#
cd /home/bryu/lxc/calypso/
./calypso.x
#################################################################
exit 0
                               submit.sh
#!/bin/bash
mpirun -np 24 -hostfile $PBS_NODEFILE /public/software/vasp5.2/vasp >>out
#cp OUTCAR OUTCAR.`date +%s`
#cp out out.`date +%s`

其他的INCAR、POSCAR KPOINTS POTCAR  calypso.X文件都是有的、但是从别人那里拷过来的calypso.X文件是记事本格式，打开全是乱码！
求高人指点迷津，不胜感激！
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努力奋斗！
1楼 2017-01-23 12:21:21
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漫天飘雪

版主 (知名作家)

认真做事，踏实做人
看到你用了两个节点，用一个试试，submit.sh  ，mpirun -np 24 vasp,试试

发自小木虫IOS客户端
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http://blog.sciencenet.cn/u/pfliu89
2楼2017-01-23 19:13:56
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msr111111

木虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 漫天飘雪 at 2017-01-23 19:13:56
看到你用了两个节点，用一个试试，submit.sh  ，mpirun -np 24 vasp,试试

试过了，没有用
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努力奋斗！
3楼2017-01-23 21:25:37
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msr111111

木虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 漫天飘雪 at 2017-01-23 19:13:56
看到你用了两个节点，用一个试试，submit.sh  ，mpirun -np 24 vasp,试试

AtomicNum  这个参数手册上没找到呢，您知道这个参数的使用格式吗
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努力奋斗！
4楼2017-01-23 21:26:19
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漫天飘雪

版主 (知名作家)

认真做事，踏实做人
你试试官方自带的例子

发自小木虫IOS客户端
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http://blog.sciencenet.cn/u/pfliu89
5楼2017-01-24 08:39:27
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msr111111

木虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by 漫天飘雪 at 2017-01-24 08:39:27
你试试官方自带的例子

找到问题所在了，谢谢大家
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努力奋斗！
6楼2017-01-24 16:54:27
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zltdcq99

金虫 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by msr111111 at 2017-01-24 16:54:27
找到问题所在了，谢谢大家...

是什么问题啊

发自小木虫Android客户端
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7楼2017-04-23 12:36:51
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窦政科

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
6楼: Originally posted by msr111111 at 2017-01-24 16:54:27
找到问题所在了，谢谢大家...

我也遇到了，这是哪里的问题了，谢谢
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龙翔天宇
8楼2018-10-31 19:47:10
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