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calypso 结构预测求助
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calypso 结构预测求助 利用同一个账号提交两个任务，先提交的任务老是处于排队中，而后提交的任务立刻就开始计算！第一个任务排队，都排几天了，觉得可能是自己提交的脚本有问题！ 提交作业后显示的信息： node10: Req'd Req'd Elap Job ID Username Queue Jobname SessID NDS TSK Memory Time S Time -------------------- -------- -------- ---------------- ------ ----- --- ------ ----- - ----- 732.inode10 bryu normal1 vasp_template -- 2 48 -- 9999: Q -- -- [bryu@node10 calypso]$ 脚本如下： test.pbs #!/bin/sh #PBS -N vasp_template #PBS -j oe #PBS -l nodes=2:ppn=24,walltime=9999:00:00 #PBS -V ################################################################# #......you only need to modify the filename of these line.......# #............or add lines similar as these......................# cd /home/bryu/lxc/calypso/ ./calypso.x ################################################################# exit 0 submit.sh #!/bin/bash mpirun -np 24 -hostfile $PBS_NODEFILE /public/software/vasp5.2/vasp >>out #cp OUTCAR OUTCAR.`date +%s` #cp out out.`date +%s` 其他的INCAR、POSCAR KPOINTS POTCAR calypso.X文件都是有的、但是从别人那里拷过来的calypso.X文件是记事本格式，打开全是乱码！ 求高人指点迷津，不胜感激！ |
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3楼2017-01-23 21:25:37
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5楼2017-01-24 08:39:27
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