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戴洪元

银虫 (初入文坛)

[求助] CTAB法提取微生物基因组DNA

最近在做牛奶微生物基因组DNA的提取,使用的是CTAB法+珠磨法,在加入CTAB及玻璃珠研磨完,70℃水浴加热20分钟后离心提取上清液,但是上清液在与酚氯仿异戊醇混合后,原本上层应该是清澈的液相,突然就变成了半透明的流体物质,且这种流体物质一旦生成,任何方法都无法消除,后将其单独吸出来,移入新的离心管中,发现流体物质又出现了分层,上层为清澈透明的液体,下层依然为半透明的的流体物质,加入异丙醇后静置一会,溶液中的半透明物质全部消失,但溶液分成了清澈透明的上下两层,我怀疑下层为氯仿,上层为异戊醇,在离心过程中氯仿与原上清液及其中的蛋白质等形成了相对稳定的乳状物质,在破坏了溶液离心后形成的稳定结构之后,上清与氯仿才分离,同时由于一部分CTAB变质,由此才导致这种情况的发生,但这又完全属于我个人的猜测,目前无任何理论依据及类似情况发生,希望有大神能帮我指点迷津,以便解决这个问题。
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珺宁

新虫 (正式写手)

2楼2017-01-21 15:11:57
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seascen2016

新虫 (小有名气)


西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2017-01-22 07:55:36
只有一管这样还是都这样?
如果都这样的话,可能是你的酚氯仿异戊醇中酚的比例不对?建议重新配一管酚氯仿异戊醇试试。
3楼2017-01-21 15:25:43
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戴洪元

银虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by seascen2016 at 2017-01-21 15:25:43
只有一管这样还是都这样?
如果都这样的话,可能是你的酚氯仿异戊醇中酚的比例不对?建议重新配一管酚氯仿异戊醇试试。

谢谢,已经找到原因——蛋白质含量太高,加入蛋白酶K消解掉后就正常了!
4楼2017-02-08 21:16:58
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