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暖如夏天0965

新虫 (初入文坛)

[求助] 高通量测序引物加了barcode后样品无法扩增出目的条带

普通引物不加barcode的可以扩增出目的条带,高通量测序的加了barcode的样品无法扩增出目的条带,美吉生物公司技术部说是barcode对样品造成了干扰,而barcode只是作为一个区分样品的标记,又不与模版结合,为何会造成干扰
该如何解决?希望小木虫的虫虫们可以给我提供一点经验或建议,小女子在此谢过了!

@biostar2009 @飞约疯人院 发自小木虫IOS客户端
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chenjunpku

新虫 (初入文坛)

自己建库?barcode与测序片段连接后有一个nick,不能用热启动PCR

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2楼2017-01-06 08:29:34
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暖如夏天0965

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by chenjunpku at 2017-01-06 08:29:34
自己建库?barcode与测序片段连接后有一个nick,不能用热启动PCR

我用的全式金的2*Easy  TagMix,普通pcr程序无法扩增出目的条带,没有用热启动pcr,现在问题就是加了barcode的引物与没有加barcode的引物相比,加了barcode的无法扩增目的条带

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3楼2017-01-06 13:58:09
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chenjunpku

新虫 (初入文坛)

如果通用测序引物能扩增出来,换为加了barcode的测序引物后应该也能扩出来,无非是多测试最佳模板,退火温度等等。

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4楼2017-01-07 05:34:32
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qx4117

银虫 (小有名气)

楼主,你好,我也遇到相同的问题,你的问题是怎么解决的?
5楼2018-10-21 08:22:07
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