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lm334723460银虫 (小有名气)
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如何从细菌complete genome中选出16s序列 已有1人参与
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比如在NCBI上搜索NC_011586.1 出现1图中的结果。 共有400多万bp，我要怎么处理才能从中找出16s的序列？ 1.png@天使托 |
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3楼2016-12-30 09:59:47
lm334723460
银虫 (小有名气)
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the bacterial pathogens database including 557 pathogenic species (Table S2) was constructed. All the 16S rRNA gene sequences of the selected bacterial pathogens are publicly available from the NCBI GenBank. The 16S rRNA gene sequences from each sample were blasted against the bacterial pathogens 16S database with an E-value b 1 × 10−10. 我主要想做这个比对。顺便问下我用于比对的序列是OTU的代表序列吗？还是其他每个样品所有的16s序列？ |
2楼2016-12-30 00:03:21
lm334723460
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4楼2016-12-30 11:04:14
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