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今时往日

新虫 (初入文坛)

[交流] 无chip级抗体但有IP抗体时做chip-seq如何选择抗体

请问做chip-seq时,在有抗体,有IP抗体,但无chip级抗体时,是优先用已有的目的蛋白IP抗体来做CHIP沉淀好,还是构建加标签蛋白的质粒,用标签抗体沉淀好呢?还有,如果用标签抗体的话,对标签抗体的种类有什么要求么?谢谢!
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jurkat.1640

至尊木虫 (文坛精英)

★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
今时往日: 金币+5, 谢谢回复,还是想请问一下,因为我的这个蛋白没有前人已知的chip结果,所以不能判断直接用蛋白抗体做出来的结果是否正确,这个会有影响么?当然加标签沉淀出来的我也不能确定是否正确。。我能判断的只是能否用抗体沉淀出来了DNA,因为是做sequence,所以也不是像chip-qPCR那种只要含有推测目的基因在就行,sequence的结果在我这种情况下会不会不靠谱? 2017-01-03 09:58:06
能用目的蛋白抗体做出来的话就没必要构建标签,分子的空间位阻看运气,融合的标签也不一定能成功。
2楼2016-12-26 16:45:43
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土豆君

银虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
标签能表达出来的话构建标签吧
爱基百客,提供专业级ChIP-seq、ATAC-seq、MeRIP-seq、RIP-seq等表观技术服务
3楼2016-12-30 09:41:46
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祝福
4楼2016-12-30 10:12:47
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5楼2017-08-21 07:23:59
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