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[交流] 无chip级抗体但有IP抗体时做chip-seq如何选择抗体

请问做chip-seq时，在有抗体，有IP抗体，但无chip级抗体时，是优先用已有的目的蛋白IP抗体来做CHIP沉淀好，还是构建加标签蛋白的质粒，用标签抗体沉淀好呢？还有，如果用标签抗体的话，对标签抗体的种类有什么要求么？谢谢！

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1楼 2016-12-26 15:19:05

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jurkat.1640

至尊木虫 (文坛精英)

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小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
今时往日: 金币+5, 谢谢回复，还是想请问一下，因为我的这个蛋白没有前人已知的chip结果，所以不能判断直接用蛋白抗体做出来的结果是否正确，这个会有影响么？当然加标签沉淀出来的我也不能确定是否正确。。我能判断的只是能否用抗体沉淀出来了DNA，因为是做sequence，所以也不是像chip-qPCR那种只要含有推测目的基因在就行，sequence的结果在我这种情况下会不会不靠谱？ 2017-01-03 09:58:06

能用目的蛋白抗体做出来的话就没必要构建标签，分子的空间位阻看运气，融合的标签也不一定能成功。