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Nigori

铜虫 (小有名气)

[交流] Northern blot实验 已有2人参与

实验方法原理

Northern blot的基本概述是将RNA样品通过变性琼脂糖凝胶电泳进行分离,再转移至尼龙膜等固相膜载体上,用放射性或非放射性标记DNA或RNA特异性探针对固定于固相膜上的mRNA进行杂交,洗膜去除非特异性结合杂交信号,经放射自显影或现色反应,对杂交信号进行分析。将杂交的mRNA分子在电泳中迁移位置与标准分子量分子进行比较,即可知道细胞中特定的基因转录产物的大小;对杂交信号的强弱比较,可以知晓该基因表达mRNA水平的强弱。

实验材料        DNA

试剂、试剂盒        MOPS电泳buffer、甲醛凝胶加样buffer、EB、EGFR探针、DIG、SSC

仪器、耗材        水平电泳仪、制冰机、恒温水浴箱、凝胶成像系统、EP管、移液器、Tip头

实验步骤

一、RNA转移与固定

1.  变性琼脂糖电泳分离总RNA样品完成后,1×MOPS buffer淋洗凝胶片刻,10×SSC中浸泡平衡凝胶30 min。

2.  按southern blot实验中DNA转移方法及装置转移总RNA至尼龙膜上(过程中注意无RNA酶操作)。
 
3.  1×SSC淋洗尼龙膜后滤纸吸干,夹在2层干净滤纸中80℃烤箱烘烤2小时。
 
4.  RNA染色,干燥的尼龙膜先于5%冰乙酸中室温浸泡15 min。

5.  于0.5 mol/L 乙酸钠和0.04%亚甲蓝溶液中浸泡5~10 min。

6.  去离子水淋洗膜5~10 min,可见RNA标准及28s及18 sRNA的条带,软铅笔标记。
 
二、预杂交、杂交及显色

1.  Washing buffer润洗1遍(3~5 min)。
 
2.  100 ml blocking buffer工作液封闭30 min。
 
3.  100 ml antibody buffer(1:5000)孵育30 min。
 
4.  Washing buffer洗膜(15 min×2)。
 
5.  20 ml detection buffer 平衡2~5 min。
 
6.  将尼龙膜置于10 ml color-substrate solution 棕色瓶中,避光数min至1天(出现颜色时不要摇动)。

7.  当出现条带时,TE-buffer洗膜(5 min×1),终止现色。
 
8.  照相记录,80℃烤干,储存。
 
9.  扫描计算EGFR基因扩增的倍数。

注意事项

1.  避免RNA酶污染,防止RNA降解。

2.  凝胶中最好不要加入EB,以免降低杂交的效率。

3.  为降低膜杂交本底,可适当延长预杂交时间。
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万然后

新虫 (初入文坛)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
那怎么确定条带大小呢?用专门做好标记的RNA marker吗

发自小木虫Android客户端
2楼2017-01-14 17:21:55
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考研加油2016

铁虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
2楼: Originally posted by 万然后 at 2017-01-14 17:21:55
那怎么确定条带大小呢?用专门做好标记的RNA marker吗

做好标记的marker是什么意思啊?
不明白自己为什么对实验不死心
3楼2018-07-30 17:29:45
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